What makes a successfull pathogen? Understanding the impact of cell-to-cell heterogeneity in chromatin structure on infection and adaptation

Información del proyecto

Cell2Cell

Identificador del acuerdo de subvención: 860675

DOI

10.3030/860675

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 11 Septiembre 2019

Fecha de inicio 1 Noviembre 2019

Fecha de finalización 30 Abril 2024

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coste total

€ 3 832 859,30

Aportación de la UE

€ 3 832 859,30

Coordinado por

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

CORDIS proporciona enlaces a los documentos públicos y las publicaciones de los proyectos de los programas marco HORIZONTE.

Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Resultado final

Other (6)

Potential inputs for Policy feedback

Consortium should include any relevant information, results, activities who could contribute to any policy development in their domain. This information could then be used for policy feedback purposes.

Summer school (Spetses)

Summer school with invited speakers held

Information flyer complete

Flyer information and design completed

Network logo designed

Cooperate image designed

Public Engagement progress review

Public Engagement progress review completed

Final conference / Career Day (Munich)

Final conference with invited speakers, modules in imaging (module 4: Microfluidics), NGS (ATAC-seq & ChIP-seq), Data Analysis (module 5: review of key aspects) and Career Day

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Website online

Cell2Cell network website design completed and online

Publicaciones

Peer reviewed articles (9)

The molecular grammar of protein disorder guiding genome-binding locations

Autores: Felix Jonas, Miri Carmi, Beniamin Krupkin, Joseph Steinberger, Sagie Brodsky, Tamar Jana, Naama Barkai
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición Vol. 51, Edición 10, 2023, Página(s) 4831-4844, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad184

Cell-to-Cell Heterogeneity in Trypanosomes

Autores: Vanessa Luzak, Lara López-Escobar, T. Nicolai Siegel, Luisa M. Figueiredo
Publicado en: Annual Review of Microbiology, Edición 75/1, 2021, Página(s) 107-128, ISSN 0066-4227
Editor: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-micro-040821-012953

The inner nuclear membrane protein Lem2 coordinates RNA degradation at the nuclear periphery

Autores: Lucía Martín Caballero, Matías Capella, Ramón Ramos Barrales, Nikolay Dobrev, Thomas van Emden, Yasuhiro Hirano, Vishnu N. Suma Sreechakram, Sabine Fischer-Burkart, Yasuha Kinugasa, Alicia Nevers, Mathieu Rougemaille, Irmgard Sinning, Tamás Fischer, Yasushi Hiraoka & Sigurd Braun
Publicado en: Nature Structural & Molecular Biology, Edición Vol. 29, 2022, Página(s) 910-921, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-022-00831-6

The 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1 is an essential upstream activator of protein kinase A in malaria parasites

Autores: Eva Hitz, Natalie Wiedemar, Armin Passecker, Beatriz A. S. Graça, Christian Scheurer, Sergio Wittlin, Nicolas M. B. Brancucci, Ioannis Vakonakis, Pascal Mäser, Till S. Voss
Publicado en: PLoS Biology, Edición 19(12), 2021, ISSN 1545-7885
Editor: Plos
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001483

A genome-wide map of DNA replication at single-molecule resolution in the malaria parasite Plasmodium falciparum

Autores: Francis Isidore Garcia Totañes, Jonas Gockel, Sarah E. Chapman, Richárd Bártfai, Michael A. Boemo, Catherine J. Merrick
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición Volume 51, Edición 6, 2023, Página(s) 2709-2724, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad093

m6A landscape is more pervasive when Trypanosoma brucei exits the cell cycle

Autores: Lúcia Serra, Sara Silva Pereira, Idálio J. Viegas, Henrique Machado, Lara López-Escobar, Luísa M. Figueiredo
Publicado en: Biomedical Journal, 2024, ISSN 0346-251X
Editor: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1101/2024.02.23.581781

Continuous distribution of cancer cells in the cell cycle unveiled by AI-segmented imaging of 37,000 HeLa FUCCI cells

Autores: Hamid Cheraghi, Kinga Dóra Kovács, Inna Székács, Robert Horvath, Bálint Szabó
Publicado en: Heliyon, Edición Volume 10, Edición 9, 2024, ISSN 2405-8440
Editor: Londen: Elsevier Ltd.
DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e30239

The troubled puberty of malaria parasites

Autores: Jonas Gockel, Till S. Voss, Richárd Bártfai
Publicado en: Trends in Parasitology, Edición Volume 39, Edición 3, 2023, Página(s) 155-157, ISSN 1097-4172
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.pt.2023.01.006

Slow growing behavior in African trypanosomes during adipose tissue colonization

Autores: Sandra Trindade, Mariana de Niz, Mariana Costa-Sequeira, Tiago Bizarra-Rebelo, Fábio Bento, Mario Dejung, Marta Valido Narciso, Lara López-Escobar, João Ferreira, Falk Butter, Frédéric Bringaud, Erida Gjini, Luisa M. Figueiredo
Publicado en: Nature Communications, Edición 13, Article number: 7548, 2022, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-34622-w

Other (2)

A systematic quantitative approach comprehensively defines domain-specific functional pathways linked to Schizosaccharomyces pombe heterochromatin regulation

Autores: Abubakar Muhammad, Zsuzsa Sarkadi, Thomas van Emden, Agnisrota Mazumder, Matias Capella, Gergely Fekete, Vishnu N. Suma Sreechakram, Bassem Al-Sady, Balázs Papp, Ramón Ramos Barrales, Sigurd Braun
Publicado en: bioRxiv, 2024
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.02.13.579970

High-resolution scRNA-seq reveals genomic determinants of antigen expression hierarchy in African Trypanosomes

Autores: Kirsty R McWilliam, Zhibek Keneskhanova, Raul O Cosentino, Atai Dobrynin, Jaclyn E Smith, Ines Subota, Monica R Mugnier, Maria Colome-Tatche, T Nicolai Siegel
Publicado en: bioRxiv, 2024
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.03.22.586247