What makes a successfull pathogen? Understanding the impact of cell-to-cell heterogeneity in chromatin structure on infection and adaptation

Projektinformationen

Cell2Cell

ID Finanzhilfevereinbarung: 860675

DOI

10.3030/860675

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 11 September 2019

Startdatum 1 November 2019

Enddatum 30 April 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 3 832 859,30

EU-Beitrag

€ 3 832 859,30

Koordiniert durch

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Other (6)

Potential inputs for Policy feedback

Consortium should include any relevant information, results, activities who could contribute to any policy development in their domain. This information could then be used for policy feedback purposes.

Summer school (Spetses)

Summer school with invited speakers held

Information flyer complete

Flyer information and design completed

Network logo designed

Cooperate image designed

Public Engagement progress review

Public Engagement progress review completed

Final conference / Career Day (Munich)

Final conference with invited speakers, modules in imaging (module 4: Microfluidics), NGS (ATAC-seq & ChIP-seq), Data Analysis (module 5: review of key aspects) and Career Day

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Website online

Cell2Cell network website design completed and online

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (9)

The molecular grammar of protein disorder guiding genome-binding locations

Autoren: Felix Jonas, Miri Carmi, Beniamin Krupkin, Joseph Steinberger, Sagie Brodsky, Tamar Jana, Naama Barkai
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe Vol. 51, Ausgabe 10, 2023, Seite(n) 4831-4844, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad184

Cell-to-Cell Heterogeneity in Trypanosomes

Autoren: Vanessa Luzak, Lara López-Escobar, T. Nicolai Siegel, Luisa M. Figueiredo
Veröffentlicht in: Annual Review of Microbiology, Ausgabe 75/1, 2021, Seite(n) 107-128, ISSN 0066-4227
Herausgeber: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-micro-040821-012953

The inner nuclear membrane protein Lem2 coordinates RNA degradation at the nuclear periphery

Autoren: Lucía Martín Caballero, Matías Capella, Ramón Ramos Barrales, Nikolay Dobrev, Thomas van Emden, Yasuhiro Hirano, Vishnu N. Suma Sreechakram, Sabine Fischer-Burkart, Yasuha Kinugasa, Alicia Nevers, Mathieu Rougemaille, Irmgard Sinning, Tamás Fischer, Yasushi Hiraoka & Sigurd Braun
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe Vol. 29, 2022, Seite(n) 910-921, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-022-00831-6

The 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1 is an essential upstream activator of protein kinase A in malaria parasites

Autoren: Eva Hitz, Natalie Wiedemar, Armin Passecker, Beatriz A. S. Graça, Christian Scheurer, Sergio Wittlin, Nicolas M. B. Brancucci, Ioannis Vakonakis, Pascal Mäser, Till S. Voss
Veröffentlicht in: PLoS Biology, Ausgabe 19(12), 2021, ISSN 1545-7885
Herausgeber: Plos
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001483

A genome-wide map of DNA replication at single-molecule resolution in the malaria parasite Plasmodium falciparum

Autoren: Francis Isidore Garcia Totañes, Jonas Gockel, Sarah E. Chapman, Richárd Bártfai, Michael A. Boemo, Catherine J. Merrick
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe Volume 51, Ausgabe 6, 2023, Seite(n) 2709-2724, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad093

m6A landscape is more pervasive when Trypanosoma brucei exits the cell cycle

Autoren: Lúcia Serra, Sara Silva Pereira, Idálio J. Viegas, Henrique Machado, Lara López-Escobar, Luísa M. Figueiredo
Veröffentlicht in: Biomedical Journal, 2024, ISSN 0346-251X
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1101/2024.02.23.581781

Continuous distribution of cancer cells in the cell cycle unveiled by AI-segmented imaging of 37,000 HeLa FUCCI cells

Autoren: Hamid Cheraghi, Kinga Dóra Kovács, Inna Székács, Robert Horvath, Bálint Szabó
Veröffentlicht in: Heliyon, Ausgabe Volume 10, Ausgabe 9, 2024, ISSN 2405-8440
Herausgeber: Londen: Elsevier Ltd.
DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e30239

The troubled puberty of malaria parasites

Autoren: Jonas Gockel, Till S. Voss, Richárd Bártfai
Veröffentlicht in: Trends in Parasitology, Ausgabe Volume 39, Ausgabe 3, 2023, Seite(n) 155-157, ISSN 1097-4172
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.pt.2023.01.006

Slow growing behavior in African trypanosomes during adipose tissue colonization

Autoren: Sandra Trindade, Mariana de Niz, Mariana Costa-Sequeira, Tiago Bizarra-Rebelo, Fábio Bento, Mario Dejung, Marta Valido Narciso, Lara López-Escobar, João Ferreira, Falk Butter, Frédéric Bringaud, Erida Gjini, Luisa M. Figueiredo
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, Article number: 7548, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-34622-w

Other (2)

A systematic quantitative approach comprehensively defines domain-specific functional pathways linked to Schizosaccharomyces pombe heterochromatin regulation

Autoren: Abubakar Muhammad, Zsuzsa Sarkadi, Thomas van Emden, Agnisrota Mazumder, Matias Capella, Gergely Fekete, Vishnu N. Suma Sreechakram, Bassem Al-Sady, Balázs Papp, Ramón Ramos Barrales, Sigurd Braun
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2024
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.02.13.579970

High-resolution scRNA-seq reveals genomic determinants of antigen expression hierarchy in African Trypanosomes

Autoren: Kirsty R McWilliam, Zhibek Keneskhanova, Raul O Cosentino, Atai Dobrynin, Jaclyn E Smith, Ines Subota, Monica R Mugnier, Maria Colome-Tatche, T Nicolai Siegel
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2024
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.03.22.586247