Dissecting the regulatory logic of poised enhancers

Informations projet

PoisedLogic

N° de convention de subvention: 862022

DOI

10.3030/862022

Projet clôturé

Date de signature de la CE 21 Avril 2020

Date de début 1 Septembre 2020

Date de fin 31 Août 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 997 662,00

Contribution de l’UE

€ 1 997 662,00

Coordonné par

UNIVERSIDAD DE CANTABRIA
Spain

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Publications

Thesis and dissertations (3)

Predicción de los mecanismos patogénicos de largo alcance de las variantes estructurales en enfermedades humanas congénitas

Auteurs: Sánchez Gaya, Víctor
Publié dans: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Numéro 1, 2024
Éditeur: UCrea (open repsoitory of the University of Cantabria)

Caracterización genómica y mecanística de la función de ZIC2 durante la inducción neural in vitro

Auteurs: María Mariner Faulí
Publié dans: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, 2024
Éditeur: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Modelización in vitro de la holoprosencefalia relacionada con ZIC2 en humanos revela genes diana sensibles a la dosis de ZIC2

Auteurs: Robert, Sarah Malika
Publié dans: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Numéro 1, 2025
Éditeur: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Other (2)

Synthetic engineering demonstrates that synergy among enhancers involves an increase in transcriptionally productive enhancer-gene contacts

Auteurs: Endika Haro, Marianna Iliadou, Shyam Ramasamy, Thais Ealo, Victor M. Campa, Tomas Pachano, A. Marieke Oudelaar, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: bioRxiv, 2026
Éditeur: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.08.669284

MLL2 facilitates long-range gene regulation through LINE1 elements

Auteurs: Lara Zorro Shahidian, Lucio Di Filippo, Sarah Malika Robert, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: bioRxiv, 2026
Éditeur: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.10.669526

Peer reviewed articles (8)

Changes in PRC1 activity during interphase modulate lineage transition in pluripotent cells

Auteurs: Helena G. Asenjo, María Alcazar-Fabra, Mencía Espinosa-Martínez, Lourdes Lopez-Onieva, Amador Gallardo, Emilia Dimitrova, Angelika Feldmann, Tomas Pachano, Jordi Martorell-Marugán, Pedro Carmona-Sáez, Antonio Sanchez-Pozo, Álvaro Rada-Iglesias, Robert J. Klose, David Landeira
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-35859-9

POSTRE: a tool to predict the pathological effects of human structural variants

Auteurs: Víctor Sánchez-Gaya, Álvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2026, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2022.06.20.496902

The chromatin, topological and regulatory properties of pluripotency-associated poised enhancers are conserved in vivo

Auteurs: Giuliano Crispatzu, Rizwan Rehimi, Tomas Pachano, Tore Bleckwehl, Sara Cruz-Molina, Cally Xiao , Esther Mahabir, Hisham Bazzi, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24641-4

Protocol to study sufficiency of cis-regulatory elements in mouse embryonic stem cells using a CRISPR-mediated knockin approach

Auteurs: Tomas Pachano, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: STAR Protocols, 2022, ISSN 2666-1667
Éditeur: New York: Cell Press Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101492

Orphan CpG islands amplify poised enhancer regulatory activity and determine target gene responsiveness

Auteurs: Tomas Pachano, Víctor Sánchez-Gaya, Thais Ealo, Maria Mariner-Faulí, Tore Bleckwehl, Helena G Asenjo, Patricia Respuela, Sara Cruz-Molina, María Muñoz-San Martín , Endika Haro, Wilfred F J van IJcken, David Landeira, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Nature Genetics, 2021, ISSN 1061-4036
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-021-00888-x

Enhancer-associated H3K4 methylation safeguards in vitro germline competence

Auteurs: Tore Bleckwehl, Giuliano Crispatzu, Kaitlin Schaaf, Patricia Respuela, Michaela Bartusel, Laura Benson, Stephen J. Clark, Kristel M. Dorighi, Antonio Barral, Magdalena Laugsch, Wilfred F. J. van IJcken, Miguel Manzanares, Joanna Wysocka, Wolf Reik & Álvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26065-6

Enhancer-gene specificity in development and disease.

Auteurs: Tomás Pachano , Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Development, 2022, ISSN 0950-1991
Éditeur: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.186536

Cooperative insulation of regulatory domains by CTCF-dependent physical insulation and promoter competition

Auteurs: Thais Ealo, Victor Sanchez-Gaya, Patricia Respuela, María Muñoz-San Martín, Elva Martin-Batista, Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-51602-4