Dissecting the regulatory logic of poised enhancers

Informations projet

PoisedLogic

N° de convention de subvention: 862022

DOI

10.3030/862022

Date de signature de la CE 21 Avril 2020

Date de début 1 Septembre 2020

Date de fin 31 Août 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 997 662,00

Contribution de l’UE

€ 1 997 662,00

Coordonné par

UNIVERSIDAD DE CANTABRIA
Spain

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Publications

Peer reviewed articles (5)

The chromatin, topological and regulatory properties of pluripotency-associated poised enhancers are conserved in vivo

Auteurs: Giuliano Crispatzu, Rizwan Rehimi, Tomas Pachano, Tore Bleckwehl, Sara Cruz-Molina, Cally Xiao , Esther Mahabir, Hisham Bazzi, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24641-4

Protocol to study sufficiency of cis-regulatory elements in mouse embryonic stem cells using a CRISPR-mediated knockin approach

Auteurs: Tomas Pachano, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: STAR Protocols, 2022, ISSN 2666-1667
Éditeur: New York: Cell Press Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101492

Orphan CpG islands amplify poised enhancer regulatory activity and determine target gene responsiveness

Auteurs: Tomas Pachano, Víctor Sánchez-Gaya, Thais Ealo, Maria Mariner-Faulí, Tore Bleckwehl, Helena G Asenjo, Patricia Respuela, Sara Cruz-Molina, María Muñoz-San Martín , Endika Haro, Wilfred F J van IJcken, David Landeira, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Nature Genetics, 2021, ISSN 1061-4036
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-021-00888-x

Enhancer-associated H3K4 methylation safeguards in vitro germline competence

Auteurs: Tore Bleckwehl, Giuliano Crispatzu, Kaitlin Schaaf, Patricia Respuela, Michaela Bartusel, Laura Benson, Stephen J. Clark, Kristel M. Dorighi, Antonio Barral, Magdalena Laugsch, Wilfred F. J. van IJcken, Miguel Manzanares, Joanna Wysocka, Wolf Reik & Álvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26065-6

Enhancer-gene specificity in development and disease.

Auteurs: Tomás Pachano , Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Publié dans: Development, 2022, ISSN 0950-1991
Éditeur: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.186536