Dissecting the regulatory logic of poised enhancers

Informazioni relative al progetto

PoisedLogic

ID dell’accordo di sovvenzione: 862022

DOI

10.3030/862022

Progetto chiuso

Data della firma CE 21 Aprile 2020

Data di avvio 1 Settembre 2020

Data di completamento 31 Agosto 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 997 662,00

Contributo UE

€ 1 997 662,00

Coordinato da

UNIVERSIDAD DE CANTABRIA
Spain

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Thesis and dissertations (3)

Predicción de los mecanismos patogénicos de largo alcance de las variantes estructurales en enfermedades humanas congénitas

Autori: Sánchez Gaya, Víctor
Pubblicato in: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Numero 1, 2024
Editore: UCrea (open repsoitory of the University of Cantabria)

Caracterización genómica y mecanística de la función de ZIC2 durante la inducción neural in vitro

Autori: María Mariner Faulí
Pubblicato in: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, 2024
Editore: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Modelización in vitro de la holoprosencefalia relacionada con ZIC2 en humanos revela genes diana sensibles a la dosis de ZIC2

Autori: Robert, Sarah Malika
Pubblicato in: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Numero 1, 2025
Editore: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Other (2)

Synthetic engineering demonstrates that synergy among enhancers involves an increase in transcriptionally productive enhancer-gene contacts

Autori: Endika Haro, Marianna Iliadou, Shyam Ramasamy, Thais Ealo, Victor M. Campa, Tomas Pachano, A. Marieke Oudelaar, Alvaro Rada-Iglesias
Pubblicato in: bioRxiv, 2026
Editore: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.08.669284

MLL2 facilitates long-range gene regulation through LINE1 elements

Autori: Lara Zorro Shahidian, Lucio Di Filippo, Sarah Malika Robert, Alvaro Rada-Iglesias
Pubblicato in: bioRxiv, 2026
Editore: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.10.669526

Peer reviewed articles (8)

Changes in PRC1 activity during interphase modulate lineage transition in pluripotent cells

Autori: Helena G. Asenjo, María Alcazar-Fabra, Mencía Espinosa-Martínez, Lourdes Lopez-Onieva, Amador Gallardo, Emilia Dimitrova, Angelika Feldmann, Tomas Pachano, Jordi Martorell-Marugán, Pedro Carmona-Sáez, Antonio Sanchez-Pozo, Álvaro Rada-Iglesias, Robert J. Klose, David Landeira
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-35859-9

POSTRE: a tool to predict the pathological effects of human structural variants

Autori: Víctor Sánchez-Gaya, Álvaro Rada-Iglesias
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, 2026, ISSN 1362-4962
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2022.06.20.496902

The chromatin, topological and regulatory properties of pluripotency-associated poised enhancers are conserved in vivo

Autori: Giuliano Crispatzu, Rizwan Rehimi, Tomas Pachano, Tore Bleckwehl, Sara Cruz-Molina, Cally Xiao , Esther Mahabir, Hisham Bazzi, Alvaro Rada-Iglesias
Pubblicato in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24641-4

Protocol to study sufficiency of cis-regulatory elements in mouse embryonic stem cells using a CRISPR-mediated knockin approach

Autori: Tomas Pachano, Alvaro Rada-Iglesias
Pubblicato in: STAR Protocols, 2022, ISSN 2666-1667
Editore: New York: Cell Press Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101492

Orphan CpG islands amplify poised enhancer regulatory activity and determine target gene responsiveness

Autori: Tomas Pachano, Víctor Sánchez-Gaya, Thais Ealo, Maria Mariner-Faulí, Tore Bleckwehl, Helena G Asenjo, Patricia Respuela, Sara Cruz-Molina, María Muñoz-San Martín , Endika Haro, Wilfred F J van IJcken, David Landeira, Alvaro Rada-Iglesias
Pubblicato in: Nature Genetics, 2021, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-021-00888-x

Enhancer-associated H3K4 methylation safeguards in vitro germline competence

Autori: Tore Bleckwehl, Giuliano Crispatzu, Kaitlin Schaaf, Patricia Respuela, Michaela Bartusel, Laura Benson, Stephen J. Clark, Kristel M. Dorighi, Antonio Barral, Magdalena Laugsch, Wilfred F. J. van IJcken, Miguel Manzanares, Joanna Wysocka, Wolf Reik & Álvaro Rada-Iglesias
Pubblicato in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26065-6

Enhancer-gene specificity in development and disease.

Autori: Tomás Pachano , Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Pubblicato in: Development, 2022, ISSN 0950-1991
Editore: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.186536

Cooperative insulation of regulatory domains by CTCF-dependent physical insulation and promoter competition

Autori: Thais Ealo, Victor Sanchez-Gaya, Patricia Respuela, María Muñoz-San Martín, Elva Martin-Batista, Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-51602-4