Dissecting the regulatory logic of poised enhancers

Informacje na temat projektu

PoisedLogic

Identyfikator umowy o grant: 862022

DOI

10.3030/862022

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 21 Kwietnia 2020

Data rozpoczęcia 1 Września 2020

Data zakończenia 31 Sierpnia 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 997 662,00

Wkład UE

€ 1 997 662,00

Koordynowany przez

UNIVERSIDAD DE CANTABRIA
Spain

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Thesis and dissertations (3)

Predicción de los mecanismos patogénicos de largo alcance de las variantes estructurales en enfermedades humanas congénitas

Autorzy: Sánchez Gaya, Víctor
Opublikowane w: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Numer 1, 2024
Wydawca: UCrea (open repsoitory of the University of Cantabria)

Caracterización genómica y mecanística de la función de ZIC2 durante la inducción neural in vitro

Autorzy: María Mariner Faulí
Opublikowane w: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, 2024
Wydawca: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Modelización in vitro de la holoprosencefalia relacionada con ZIC2 en humanos revela genes diana sensibles a la dosis de ZIC2

Autorzy: Robert, Sarah Malika
Opublikowane w: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Numer 1, 2025
Wydawca: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Other (2)

Synthetic engineering demonstrates that synergy among enhancers involves an increase in transcriptionally productive enhancer-gene contacts

Autorzy: Endika Haro, Marianna Iliadou, Shyam Ramasamy, Thais Ealo, Victor M. Campa, Tomas Pachano, A. Marieke Oudelaar, Alvaro Rada-Iglesias
Opublikowane w: bioRxiv, 2026
Wydawca: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.08.669284

MLL2 facilitates long-range gene regulation through LINE1 elements

Autorzy: Lara Zorro Shahidian, Lucio Di Filippo, Sarah Malika Robert, Alvaro Rada-Iglesias
Opublikowane w: bioRxiv, 2026
Wydawca: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.10.669526

Peer reviewed articles (8)

Changes in PRC1 activity during interphase modulate lineage transition in pluripotent cells

Autorzy: Helena G. Asenjo, María Alcazar-Fabra, Mencía Espinosa-Martínez, Lourdes Lopez-Onieva, Amador Gallardo, Emilia Dimitrova, Angelika Feldmann, Tomas Pachano, Jordi Martorell-Marugán, Pedro Carmona-Sáez, Antonio Sanchez-Pozo, Álvaro Rada-Iglesias, Robert J. Klose, David Landeira
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 14, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-35859-9

POSTRE: a tool to predict the pathological effects of human structural variants

Autorzy: Víctor Sánchez-Gaya, Álvaro Rada-Iglesias
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, 2026, ISSN 1362-4962
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2022.06.20.496902

The chromatin, topological and regulatory properties of pluripotency-associated poised enhancers are conserved in vivo

Autorzy: Giuliano Crispatzu, Rizwan Rehimi, Tomas Pachano, Tore Bleckwehl, Sara Cruz-Molina, Cally Xiao , Esther Mahabir, Hisham Bazzi, Alvaro Rada-Iglesias
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24641-4

Protocol to study sufficiency of cis-regulatory elements in mouse embryonic stem cells using a CRISPR-mediated knockin approach

Autorzy: Tomas Pachano, Alvaro Rada-Iglesias
Opublikowane w: STAR Protocols, 2022, ISSN 2666-1667
Wydawca: New York: Cell Press Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101492

Orphan CpG islands amplify poised enhancer regulatory activity and determine target gene responsiveness

Autorzy: Tomas Pachano, Víctor Sánchez-Gaya, Thais Ealo, Maria Mariner-Faulí, Tore Bleckwehl, Helena G Asenjo, Patricia Respuela, Sara Cruz-Molina, María Muñoz-San Martín , Endika Haro, Wilfred F J van IJcken, David Landeira, Alvaro Rada-Iglesias
Opublikowane w: Nature Genetics, 2021, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-021-00888-x

Enhancer-associated H3K4 methylation safeguards in vitro germline competence

Autorzy: Tore Bleckwehl, Giuliano Crispatzu, Kaitlin Schaaf, Patricia Respuela, Michaela Bartusel, Laura Benson, Stephen J. Clark, Kristel M. Dorighi, Antonio Barral, Magdalena Laugsch, Wilfred F. J. van IJcken, Miguel Manzanares, Joanna Wysocka, Wolf Reik & Álvaro Rada-Iglesias
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26065-6

Enhancer-gene specificity in development and disease.

Autorzy: Tomás Pachano , Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Opublikowane w: Development, 2022, ISSN 0950-1991
Wydawca: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.186536

Cooperative insulation of regulatory domains by CTCF-dependent physical insulation and promoter competition

Autorzy: Thais Ealo, Victor Sanchez-Gaya, Patricia Respuela, María Muñoz-San Martín, Elva Martin-Batista, Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-51602-4