Dissecting the regulatory logic of poised enhancers

Projektinformationen

PoisedLogic

ID Finanzhilfevereinbarung: 862022

DOI

10.3030/862022

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 21 April 2020

Startdatum 1 September 2020

Enddatum 31 August 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 997 662,00

EU-Beitrag

€ 1 997 662,00

Koordiniert durch

UNIVERSIDAD DE CANTABRIA
Spain

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Veröffentlichungen

Thesis and dissertations (3)

Predicción de los mecanismos patogénicos de largo alcance de las variantes estructurales en enfermedades humanas congénitas

Autoren: Sánchez Gaya, Víctor
Veröffentlicht in: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Ausgabe 1, 2024
Herausgeber: UCrea (open repsoitory of the University of Cantabria)

Caracterización genómica y mecanística de la función de ZIC2 durante la inducción neural in vitro

Autoren: María Mariner Faulí
Veröffentlicht in: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, 2024
Herausgeber: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Modelización in vitro de la holoprosencefalia relacionada con ZIC2 en humanos revela genes diana sensibles a la dosis de ZIC2

Autoren: Robert, Sarah Malika
Veröffentlicht in: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Ausgabe 1, 2025
Herausgeber: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Other (2)

Synthetic engineering demonstrates that synergy among enhancers involves an increase in transcriptionally productive enhancer-gene contacts

Autoren: Endika Haro, Marianna Iliadou, Shyam Ramasamy, Thais Ealo, Victor M. Campa, Tomas Pachano, A. Marieke Oudelaar, Alvaro Rada-Iglesias
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.08.669284

MLL2 facilitates long-range gene regulation through LINE1 elements

Autoren: Lara Zorro Shahidian, Lucio Di Filippo, Sarah Malika Robert, Alvaro Rada-Iglesias
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.10.669526

Peer reviewed articles (8)

Changes in PRC1 activity during interphase modulate lineage transition in pluripotent cells

Autoren: Helena G. Asenjo, María Alcazar-Fabra, Mencía Espinosa-Martínez, Lourdes Lopez-Onieva, Amador Gallardo, Emilia Dimitrova, Angelika Feldmann, Tomas Pachano, Jordi Martorell-Marugán, Pedro Carmona-Sáez, Antonio Sanchez-Pozo, Álvaro Rada-Iglesias, Robert J. Klose, David Landeira
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-35859-9

POSTRE: a tool to predict the pathological effects of human structural variants

Autoren: Víctor Sánchez-Gaya, Álvaro Rada-Iglesias
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, 2026, ISSN 1362-4962
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2022.06.20.496902

The chromatin, topological and regulatory properties of pluripotency-associated poised enhancers are conserved in vivo

Autoren: Giuliano Crispatzu, Rizwan Rehimi, Tomas Pachano, Tore Bleckwehl, Sara Cruz-Molina, Cally Xiao , Esther Mahabir, Hisham Bazzi, Alvaro Rada-Iglesias
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24641-4

Protocol to study sufficiency of cis-regulatory elements in mouse embryonic stem cells using a CRISPR-mediated knockin approach

Autoren: Tomas Pachano, Alvaro Rada-Iglesias
Veröffentlicht in: STAR Protocols, 2022, ISSN 2666-1667
Herausgeber: New York: Cell Press Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101492

Orphan CpG islands amplify poised enhancer regulatory activity and determine target gene responsiveness

Autoren: Tomas Pachano, Víctor Sánchez-Gaya, Thais Ealo, Maria Mariner-Faulí, Tore Bleckwehl, Helena G Asenjo, Patricia Respuela, Sara Cruz-Molina, María Muñoz-San Martín , Endika Haro, Wilfred F J van IJcken, David Landeira, Alvaro Rada-Iglesias
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2021, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-021-00888-x

Enhancer-associated H3K4 methylation safeguards in vitro germline competence

Autoren: Tore Bleckwehl, Giuliano Crispatzu, Kaitlin Schaaf, Patricia Respuela, Michaela Bartusel, Laura Benson, Stephen J. Clark, Kristel M. Dorighi, Antonio Barral, Magdalena Laugsch, Wilfred F. J. van IJcken, Miguel Manzanares, Joanna Wysocka, Wolf Reik & Álvaro Rada-Iglesias
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26065-6

Enhancer-gene specificity in development and disease.

Autoren: Tomás Pachano , Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Veröffentlicht in: Development, 2022, ISSN 0950-1991
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.186536

Cooperative insulation of regulatory domains by CTCF-dependent physical insulation and promoter competition

Autoren: Thais Ealo, Victor Sanchez-Gaya, Patricia Respuela, María Muñoz-San Martín, Elva Martin-Batista, Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-51602-4