Dissecting the regulatory logic of poised enhancers

Información del proyecto

PoisedLogic

Identificador del acuerdo de subvención: 862022

DOI

10.3030/862022

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 21 Abril 2020

Fecha de inicio 1 Septiembre 2020

Fecha de finalización 31 Agosto 2026

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 997 662,00

Aportación de la UE

€ 1 997 662,00

Coordinado por

UNIVERSIDAD DE CANTABRIA
Spain

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Publicaciones

Thesis and dissertations (3)

Predicción de los mecanismos patogénicos de largo alcance de las variantes estructurales en enfermedades humanas congénitas

Autores: Sánchez Gaya, Víctor
Publicado en: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Edición 1, 2024
Editor: UCrea (open repsoitory of the University of Cantabria)

Caracterización genómica y mecanística de la función de ZIC2 durante la inducción neural in vitro

Autores: María Mariner Faulí
Publicado en: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, 2024
Editor: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Modelización in vitro de la holoprosencefalia relacionada con ZIC2 en humanos revela genes diana sensibles a la dosis de ZIC2

Autores: Robert, Sarah Malika
Publicado en: reponame:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria, Edición 1, 2025
Editor: UCrea (open repository of the University of Cantabria)

Other (2)

Synthetic engineering demonstrates that synergy among enhancers involves an increase in transcriptionally productive enhancer-gene contacts

Autores: Endika Haro, Marianna Iliadou, Shyam Ramasamy, Thais Ealo, Victor M. Campa, Tomas Pachano, A. Marieke Oudelaar, Alvaro Rada-Iglesias
Publicado en: bioRxiv, 2026
Editor: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.08.669284

MLL2 facilitates long-range gene regulation through LINE1 elements

Autores: Lara Zorro Shahidian, Lucio Di Filippo, Sarah Malika Robert, Alvaro Rada-Iglesias
Publicado en: bioRxiv, 2026
Editor: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.10.669526

Peer reviewed articles (8)

Changes in PRC1 activity during interphase modulate lineage transition in pluripotent cells

Autores: Helena G. Asenjo, María Alcazar-Fabra, Mencía Espinosa-Martínez, Lourdes Lopez-Onieva, Amador Gallardo, Emilia Dimitrova, Angelika Feldmann, Tomas Pachano, Jordi Martorell-Marugán, Pedro Carmona-Sáez, Antonio Sanchez-Pozo, Álvaro Rada-Iglesias, Robert J. Klose, David Landeira
Publicado en: Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-35859-9

POSTRE: a tool to predict the pathological effects of human structural variants

Autores: Víctor Sánchez-Gaya, Álvaro Rada-Iglesias
Publicado en: Nucleic Acids Research, 2026, ISSN 1362-4962
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2022.06.20.496902

The chromatin, topological and regulatory properties of pluripotency-associated poised enhancers are conserved in vivo

Autores: Giuliano Crispatzu, Rizwan Rehimi, Tomas Pachano, Tore Bleckwehl, Sara Cruz-Molina, Cally Xiao , Esther Mahabir, Hisham Bazzi, Alvaro Rada-Iglesias
Publicado en: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24641-4

Protocol to study sufficiency of cis-regulatory elements in mouse embryonic stem cells using a CRISPR-mediated knockin approach

Autores: Tomas Pachano, Alvaro Rada-Iglesias
Publicado en: STAR Protocols, 2022, ISSN 2666-1667
Editor: New York: Cell Press Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101492

Orphan CpG islands amplify poised enhancer regulatory activity and determine target gene responsiveness

Autores: Tomas Pachano, Víctor Sánchez-Gaya, Thais Ealo, Maria Mariner-Faulí, Tore Bleckwehl, Helena G Asenjo, Patricia Respuela, Sara Cruz-Molina, María Muñoz-San Martín , Endika Haro, Wilfred F J van IJcken, David Landeira, Alvaro Rada-Iglesias
Publicado en: Nature Genetics, 2021, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-021-00888-x

Enhancer-associated H3K4 methylation safeguards in vitro germline competence

Autores: Tore Bleckwehl, Giuliano Crispatzu, Kaitlin Schaaf, Patricia Respuela, Michaela Bartusel, Laura Benson, Stephen J. Clark, Kristel M. Dorighi, Antonio Barral, Magdalena Laugsch, Wilfred F. J. van IJcken, Miguel Manzanares, Joanna Wysocka, Wolf Reik & Álvaro Rada-Iglesias
Publicado en: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26065-6

Enhancer-gene specificity in development and disease.

Autores: Tomás Pachano , Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Publicado en: Development, 2022, ISSN 0950-1991
Editor: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.186536

Cooperative insulation of regulatory domains by CTCF-dependent physical insulation and promoter competition

Autores: Thais Ealo, Victor Sanchez-Gaya, Patricia Respuela, María Muñoz-San Martín, Elva Martin-Batista, Endika Haro, Alvaro Rada-Iglesias
Publicado en: Nature Communications, Edición 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-51602-4