Descripción del proyecto
Creación de una red de genotecas innovadora
En su función de almacenes de semillas o tejido vegetativo, las genotecas sirven para la conservación de semillas. Se crearon para preservar el material genético con la idea de que pudieran utilizarse en el futuro en programas de mejora genética. El proyecto AGENT, financiado con fondos europeos, transformará las genotecas de archivos vivos a centros de recursos biodigitales capaces de hacer frente a los nuevos desafíos tecnológicos de la agronomía. Un consorcio de quince genotecas y cuatro centros genómicos de genotecas creará una red que se centrará en la cebada y el trigo. En el proyecto se constituirá un atlas europeo (mundial) de la diversidad genómica de los cultivos, se activarán los datos fenotípicos heredados actualmente inaccesibles y se iniciará un nuevo concepto de acumulación concertada de datos fenológicos y agronómicos para colecciones particulares de recursos genéticos. El fenotipado tendrá en cuenta las diversas condiciones de los datos ambientales.
Objetivo
AGENT aims to transform genebanks (GB) from living archives into bio-digital resources centres, equipped to meet the needs of a changing world. Fifteen GB and four genebank genomic centers will create a network to work exemplarily on barley and wheat for (i) establishing a European (global) crop genomic diversity atlas, (ii) activating currently inaccessible legacy phenotypic data, (iii) implementing a novel concept of concerted accumulation of phenologic and agronomic data for individual GenRes collections to establish training population datasets for the genome-wide prediction of untested GenRes accessions. Phenotyping will take into account diverse environmental conditions (climate, soil, geography, pathogens) provided by the diversity of eco-geographic locations of the participating GB and their partners. These activities will be supported by a bioinformatics network that will implement FAIR data principles, standards, protocols, and data formats enabling data storage, access, use, and re-use, extending the existing EURISCO GenRes portal for new data types. AGENT will use existing solutions established by ongoing European projects and international initiatives, but also develop new tools for novel functionality of data access, visualisation, and use, which will be connected and implemented via plugin or web-services, allowing their incorporation in EURISCO and other data portals, and their easy application to other crop GenRes, based on data already available at EURISCO or provided by AGENT partner GB. A coordinated testing network is another unique layer of AGENT, directly involving stakeholders (e.g. farmer cooperatives, breeding companies, NGOs) in monitoring, mentoring, capacity building and training in the development of workflows and tools. Thus, AGENT project results will be directly disseminated to GB, researchers, breeders, policy makers and the general public and raise awareness of the general as well as the specific societal importance of GenRes.
Ámbito científico
Palabras clave
Programa(s)
Convocatoria de propuestas
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H2020-SFS-2019-2
Régimen de financiación
RIA - Research and Innovation actionCoordinador
06466 Seeland Ot Gatersleben
Alemania
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Participantes (20)
La participación finalizó
190000 ST PETERSBURG
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05-870 Blonie
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Entidad jurídica distinta de un subcontratista que está afiliada o vinculada jurídicamente con un participante. Dicha entidad lleva a cabo su trabajo en las condiciones establecidas en el acuerdo de subvención, proporciona bienes o presta servicios para la acción, pero no firma dicho acuerdo. El tercero acata las normas aplicables a su participante en virtud del acuerdo de subvención en lo que respecta a la subvencionalidad de los costes y el control de los gastos.
20-950 Lublin
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4122 Sadovo
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16106 Praha 6
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Entidad jurídica distinta de un subcontratista que está afiliada o vinculada jurídicamente con un participante. Dicha entidad lleva a cabo su trabajo en las condiciones establecidas en el acuerdo de subvención, proporciona bienes o presta servicios para la acción, pero no firma dicho acuerdo. El tercero acata las normas aplicables a su participante en virtud del acuerdo de subvención en lo que respecta a la subvencionalidad de los costes y el control de los gastos.
767 01 Kromeriz
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Organización definida por ella misma como pequeña y mediana empresa (pyme) en el momento de la firma del acuerdo de subvención.
69978 Tel Aviv
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2462 Martonvasar
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28006 Madrid
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6708 PB Wageningen
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915200 Fundulea
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951 41 Luzianky
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00184 Roma
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8006 Zurich
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66386 St Ingbert
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Organización definida por ella misma como pequeña y mediana empresa (pyme) en el momento de la firma del acuerdo de subvención.
Beirut
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75007 Paris
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TW93AB Richmond
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00153 ROMA
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3003 Bern
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