Descrizione del progetto
Istituire una rete innovativa di banche genetiche
Le banche genetiche che fungono da magazzini di sementi e tessuti vegetativi sono destinate alla conservazione dei semi. Esse furono create per la preservazione del materiale genetico con lo scopo di poter essere utilizzate in futuro nei programmi di selezione. Il progetto AGENT, finanziato dall’UE, si prefigge di trasformare le banche genetiche da archivi viventi in centri di risorse bio-digitali capaci di affrontare le nuove sfide tecnologiche dell’agronomia. Un consorzio composto da 15 banche genetiche e quattro centri genomici di banche genetiche consoliderà una rete incentrata su orzo e grano. Il progetto realizzerà un atlante europeo (globale) della diversità genomica delle colture, attiverà dati sul patrimonio fenotipico attualmente inaccessibili e darà vita a uno concetto di accumulazione concordata di dati fenologici e agronomici per singole raccolte di risorse genetiche. La fenotipizzazione prenderà in esame le condizioni diversificate dei dati ambientali.
Obiettivo
AGENT aims to transform genebanks (GB) from living archives into bio-digital resources centres, equipped to meet the needs of a changing world. Fifteen GB and four genebank genomic centers will create a network to work exemplarily on barley and wheat for (i) establishing a European (global) crop genomic diversity atlas, (ii) activating currently inaccessible legacy phenotypic data, (iii) implementing a novel concept of concerted accumulation of phenologic and agronomic data for individual GenRes collections to establish training population datasets for the genome-wide prediction of untested GenRes accessions. Phenotyping will take into account diverse environmental conditions (climate, soil, geography, pathogens) provided by the diversity of eco-geographic locations of the participating GB and their partners. These activities will be supported by a bioinformatics network that will implement FAIR data principles, standards, protocols, and data formats enabling data storage, access, use, and re-use, extending the existing EURISCO GenRes portal for new data types. AGENT will use existing solutions established by ongoing European projects and international initiatives, but also develop new tools for novel functionality of data access, visualisation, and use, which will be connected and implemented via plugin or web-services, allowing their incorporation in EURISCO and other data portals, and their easy application to other crop GenRes, based on data already available at EURISCO or provided by AGENT partner GB. A coordinated testing network is another unique layer of AGENT, directly involving stakeholders (e.g. farmer cooperatives, breeding companies, NGOs) in monitoring, mentoring, capacity building and training in the development of workflows and tools. Thus, AGENT project results will be directly disseminated to GB, researchers, breeders, policy makers and the general public and raise awareness of the general as well as the specific societal importance of GenRes.
Campo scientifico
Parole chiave
Programma(i)
Meccanismo di finanziamento
RIA - Research and Innovation actionCoordinatore
06466 Seeland Ot Gatersleben
Germania
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Partecipanti (20)
Partecipazione conclusa
190000 ST PETERSBURG
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05-870 Blonie
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Soggetto giuridico diverso da un subappaltatore che è affiliato o legalmente collegato a un partecipante. Il soggetto svolge le attività secondo le condizioni stabilite nell’accordo di sovvenzione, fornisce beni o servizi per l’azione, ma non ha sottoscritto l’accordo di sovvenzione. Una terza parte rispetta le regole applicabili al suo partecipante correlato ai sensi dell’accordo di sovvenzione per quanto riguarda l’ammissibilità dei costi e il controllo delle spese.
20-950 Lublin
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4122 Sadovo
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16106 Praha 6
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Soggetto giuridico diverso da un subappaltatore che è affiliato o legalmente collegato a un partecipante. Il soggetto svolge le attività secondo le condizioni stabilite nell’accordo di sovvenzione, fornisce beni o servizi per l’azione, ma non ha sottoscritto l’accordo di sovvenzione. Una terza parte rispetta le regole applicabili al suo partecipante correlato ai sensi dell’accordo di sovvenzione per quanto riguarda l’ammissibilità dei costi e il controllo delle spese.
767 01 Kromeriz
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L’organizzazione si è definita una PMI (piccola e media impresa) al momento della firma dell’accordo di sovvenzione.
69978 Tel Aviv
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2462 Martonvasar
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28006 Madrid
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6708 PB Wageningen
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915200 Fundulea
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951 41 Luzianky
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00184 Roma
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8006 Zurich
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66386 St Ingbert
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L’organizzazione si è definita una PMI (piccola e media impresa) al momento della firma dell’accordo di sovvenzione.
Beirut
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75007 Paris
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TW93AB Richmond
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00153 ROMA
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3003 Bern
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