Description du projet
Mettre en place un réseau innovant de banques de gènes
En tant qu’entrepôts de semences ou de tissus végétatifs, les banques de gènes se consacrent à la conservation des semences. Elles ont été créées pour préserver le matériel génétique dans l’idée qu’il pourrait être utilisé à l’avenir dans des programmes de sélection. Le projet AGENT, financé par l’UE, transformera les archives vivantes que sont les banques de gènes en centres de ressources bio-numériques capables de faire face aux nouveaux défis technologiques du secteur agronomique. Un consortium de quinze banques de gènes et de quatre centres de génomique de banques de gènes constituera un réseau qui mettra l’accent sur l’orge et le blé. Par ailleurs, le projet établira un atlas européen (mondial) de la diversité génomique des cultures, activera les données phénotypiques héritées actuellement inaccessibles et lancera un nouveau concept d’accumulation concertée de données phénologiques et agronomiques pour les collections individuelles de ressources génétiques. Le phénotypage prendra en considération diverses conditions de données environnementales.
Objectif
AGENT aims to transform genebanks (GB) from living archives into bio-digital resources centres, equipped to meet the needs of a changing world. Fifteen GB and four genebank genomic centers will create a network to work exemplarily on barley and wheat for (i) establishing a European (global) crop genomic diversity atlas, (ii) activating currently inaccessible legacy phenotypic data, (iii) implementing a novel concept of concerted accumulation of phenologic and agronomic data for individual GenRes collections to establish training population datasets for the genome-wide prediction of untested GenRes accessions. Phenotyping will take into account diverse environmental conditions (climate, soil, geography, pathogens) provided by the diversity of eco-geographic locations of the participating GB and their partners. These activities will be supported by a bioinformatics network that will implement FAIR data principles, standards, protocols, and data formats enabling data storage, access, use, and re-use, extending the existing EURISCO GenRes portal for new data types. AGENT will use existing solutions established by ongoing European projects and international initiatives, but also develop new tools for novel functionality of data access, visualisation, and use, which will be connected and implemented via plugin or web-services, allowing their incorporation in EURISCO and other data portals, and their easy application to other crop GenRes, based on data already available at EURISCO or provided by AGENT partner GB. A coordinated testing network is another unique layer of AGENT, directly involving stakeholders (e.g. farmer cooperatives, breeding companies, NGOs) in monitoring, mentoring, capacity building and training in the development of workflows and tools. Thus, AGENT project results will be directly disseminated to GB, researchers, breeders, policy makers and the general public and raise awareness of the general as well as the specific societal importance of GenRes.
Champ scientifique
Mots‑clés
Programme(s)
Régime de financement
RIA - Research and Innovation actionCoordinateur
06466 Seeland Ot Gatersleben
Allemagne
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Participants (20)
Participation terminée
190000 ST PETERSBURG
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05-870 Blonie
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Entité juridique autre qu’un sous-traitant qui est affiliée ou juridiquement liée à un participant. L’entité réalise des travaux dans les conditions prévues par la convention de subvention, fournit des biens ou des services pour l’action, mais n’a pas signé la convention de subvention. Le tiers respecte les règles applicables au participant qui lui est lié dans le cadre de la convention de subvention en ce qui concerne l’éligibilité des coûts et le contrôle des dépenses.
20-950 Lublin
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4122 Sadovo
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16106 Praha 6
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Entité juridique autre qu’un sous-traitant qui est affiliée ou juridiquement liée à un participant. L’entité réalise des travaux dans les conditions prévues par la convention de subvention, fournit des biens ou des services pour l’action, mais n’a pas signé la convention de subvention. Le tiers respecte les règles applicables au participant qui lui est lié dans le cadre de la convention de subvention en ce qui concerne l’éligibilité des coûts et le contrôle des dépenses.
767 01 Kromeriz
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
69978 Tel Aviv
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2462 Martonvasar
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28006 Madrid
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6708 PB Wageningen
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915200 Fundulea
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951 41 Luzianky
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00184 Roma
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8006 Zurich
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66386 St Ingbert
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
Beirut
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75007 Paris
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TW93AB Richmond
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00153 ROMA
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3003 Bern
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