CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Activated GEnebank NeTwork

Opis projektu

Budowa innowacyjnej sieci banków genów

Banki genów przechowujące nasiona oraz organy wegetatywne skupiają się na ochronie i zachowaniu nasion. Instytucje tego rodzaju powstały w celu ochrony materiału genetycznego z myślą o wykorzystaniu go w przyszłości w programach hodowlanych. Uczestnicy finansowanego przez Unię Europejską projektu AGENT zamierzają zmienić banki genów z żywych archiwów w ośrodki zasobów biologicznych i cyfrowych, dzięki którym będą w stanie skutecznie stawić czoła wyzwaniom technologicznym w agronomii. Konsorcjum składające się z 15 banków genów i czterech ośrodków genomicznych banków genów stworzy sieć, która skupi swoje działania na jęczmieniu i pszenicy. W ramach projektu powstanie europejski (globalny) atlas różnorodności genetycznej roślin uprawnych, dzięki któremu będzie możliwe aktywowanie niedostępnych dotychczas danych fenotypowych. Ponadto uczestnicy zainicjują nową koncepcję wspólnego gromadzenia danych fenologicznych i agronomicznych dla poszczególnych zbiorów zasobów genetycznych. Fenotypowanie będzie uwzględniało zróżnicowane warunki danych środowiskowych.

Cel

AGENT aims to transform genebanks (GB) from living archives into bio-digital resources centres, equipped to meet the needs of a changing world. Fifteen GB and four genebank genomic centers will create a network to work exemplarily on barley and wheat for (i) establishing a European (global) crop genomic diversity atlas, (ii) activating currently inaccessible legacy phenotypic data, (iii) implementing a novel concept of concerted accumulation of phenologic and agronomic data for individual GenRes collections to establish training population datasets for the genome-wide prediction of untested GenRes accessions. Phenotyping will take into account diverse environmental conditions (climate, soil, geography, pathogens) provided by the diversity of eco-geographic locations of the participating GB and their partners. These activities will be supported by a bioinformatics network that will implement FAIR data principles, standards, protocols, and data formats enabling data storage, access, use, and re-use, extending the existing EURISCO GenRes portal for new data types. AGENT will use existing solutions established by ongoing European projects and international initiatives, but also develop new tools for novel functionality of data access, visualisation, and use, which will be connected and implemented via plugin or web-services, allowing their incorporation in EURISCO and other data portals, and their easy application to other crop GenRes, based on data already available at EURISCO or provided by AGENT partner GB. A coordinated testing network is another unique layer of AGENT, directly involving stakeholders (e.g. farmer cooperatives, breeding companies, NGOs) in monitoring, mentoring, capacity building and training in the development of workflows and tools. Thus, AGENT project results will be directly disseminated to GB, researchers, breeders, policy makers and the general public and raise awareness of the general as well as the specific societal importance of GenRes.

Zaproszenie do składania wniosków

H2020-SFS-2018-2020

Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

Szczegółowe działanie

H2020-SFS-2019-2

Koordynator

LEIBNIZ - INSTITUT FUER PFLANZENGENETIK UND KULTURPFLANZENFORSCHUNG
Wkład UE netto
€ 966 250,00
Adres
CORRENSTRASSE 3
06466 Seeland Ot Gatersleben
Niemcy

Zobacz na mapie

Region
Sachsen-Anhalt Sachsen-Anhalt Salzlandkreis
Rodzaj działalności
Research Organisations
Linki
Koszt całkowity
€ 966 250,00

Uczestnicy (20)