Descrizione del progetto DEENESFRITPL Potrebbe essere la qualità e non la quantità che conta quando si tratta di proteine Le proteine sono onnipresenti, mediando i ruoli strutturali e funzionali di tutte le cellule. La disfunzione delle proteine è strettamente coinvolta nella malattia e un modo importante per valutarne l’attività è lo screening della loro espressione (saggi proteomici che considerano la serie completa di proteine espresse da un organismo). Tuttavia, molti processi patologici potrebbero alterare la funzione proteica, strettamente correlata alla struttura, senza alterare l’espressione. Il prodotto Proteomes-in-3D, finanziato dall’UE, sta testando una nuova metodologia per misurare le strutture alterate nell’ambito dell’intero proteoma di un organismo e stabilire se siano correlate a fenotipi complessi. Il gruppo di ricerca si sta concentrando sugli aggregati proteici o superassemblaggi (SA), dato che gli SA sono coinvolti nei processi sia patologici che non. Inoltre, creeranno un atlante delle dinamiche proteomiche strutturali dai dati generati nel corso dell’intero progetto allo scopo di fornire una solida base per gli studi futuri del proteoma strutturale. Mostra l’obiettivo del progetto Nascondi l’obiettivo del progetto Obiettivo Protein expression screens are routinely used to identify biological processes deregulated upon disease development or upon specific cellular perturbations. Generating molecular hypotheses from these ‘omic data remains challenging, however, and many molecular events that modulate protein function do not involve altered protein levels. With this project, I propose a new paradigm. I propose that by measuring altered structures of proteins on a global scale, we can capture altered functional states of proteins and proteomes. I propose that the new approach will support the generation of testable molecular hypotheses from global data and the development of new frameworks for the modelling of biological systems. Building on a unique mass spectrometric approach my lab developed, which captures protein structural changes on a proteome-wide scale, we will assess the performance of the global structural readout at analyzing complex phenotypes. We will apply it to a biomedical problem of interest to my lab: the functional and pathological implications of protein aggregates or superassemblies (SAs). Protein aggregates form not only during disease but also under physiological conditions. These structures regulate important normal processes and contribute to cellular architecture. Using the new structural approach, we will identify and characterize networks of novel functional SAs in E. coli, mouse, and human proteomes. We will assess how genomic variation, environment and age modulate protein structures and SA assembly and how SAs are linked to phenotypes. Last, we will translate our approach to a clinical setting and ask whether altered protein structures can serve as biomarkers of disease, specifically Parkinson’s disease and how SAs underlie Parkinson’s subtypes. We will collect the wealth of dynamic structural data generated through this project into an Atlas of Structural Proteome Dynamics and use the data to shed new light on features of the structural proteome. Campo scientifico scienze naturaliscienze biologichebiochimicabiomolecoleproteineproteomicascienze mediche e della salutemedicina di baseneurologiaparkinson Programma(i) H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC) Main Programme Argomento(i) ERC-2019-COG - ERC Consolidator Grant Invito a presentare proposte ERC-2019-COG Vedi altri progetti per questo bando Meccanismo di finanziamento ERC-COG - Consolidator Grant Coordinatore EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH Contribution nette de l'UE € 2 000 000,00 Indirizzo Raemistrasse 101 8092 Zuerich Svizzera Mostra sulla mappa Regione Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich Tipo di attività Higher or Secondary Education Establishments Collegamenti Contatta l’organizzazione Opens in new window Sito web Opens in new window Partecipazione a programmi di R&I dell'UE Opens in new window Rete di collaborazione HORIZON Opens in new window Altri finanziamenti € 0,00 Beneficiari (1) Classifica in ordine alfabetico Classifica per Contributo netto dell'UE Espandi tutto Riduci tutto EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH Svizzera Contribution nette de l'UE € 2 000 000,00 Indirizzo Raemistrasse 101 8092 Zuerich Mostra sulla mappa Regione Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich Tipo di attività Higher or Secondary Education Establishments Collegamenti Contatta l’organizzazione Opens in new window Sito web Opens in new window Partecipazione a programmi di R&I dell'UE Opens in new window Rete di collaborazione HORIZON Opens in new window Altri finanziamenti € 0,00
