Skip to main content
DeutschDE
European Commission logo print header

Three-dimensional dynamic views of proteomes as a novel readout for physiological and pathological alterations

Projektbeschreibung

DEENESFRITPL

Vielleicht kommt es bei Proteinen auf die Qualität, nicht auf die Quantität, an

Proteine sind allgegenwärtig. Sie vermitteln die strukturellen und funktionellen Rollen in allen Zellen. Ihre Dysfunktion steht in enger Verbindung mit Erkrankungen. Eine wichtige Strategie, um ihre Aktivität zu beurteilen, ist ein Screening ihrer Expression. Dabei wird mit proteomischen Assays die Gesamtheit der Proteine, die von einem Organismus exprimiert werden, untersucht. Bei vielen Erkrankungen verändert sich jedoch die Funktion der Proteine, die eng mit der Struktur verbunden ist, ohne dass sich die Expression verändert. Das EU-finanzierte Projekt Proteomes-in-3D testet eine neuartige Methode zur Messung veränderter Strukturen im gesamten Proteom eines Organismus. So soll festgestellt werden, ob sie mit komplexen Phänotypen in Zusammenhang stehen. Das Projektteam konzentriert sich auf Proteinaggregate oder Superansammlungen, da es annimmt, dass diese an Vorgängen im normalen und im erkrankten Zustand beteiligt sind. Darüber hinaus wird es aus Daten, die im Rahmen des Projekts generiert werden, einen Atlas über die strukturelle Proteomdynamik erstellen, um eine solide Grundlage für künftige Studien des strukturellen Proteoms bereitzustellen.

Ziel

Protein expression screens are routinely used to identify biological processes deregulated upon disease development or upon specific cellular perturbations. Generating molecular hypotheses from these ‘omic data remains challenging, however, and many molecular events that modulate protein function do not involve altered protein levels. With this project, I propose a new paradigm. I propose that by measuring altered structures of proteins on a global scale, we can capture altered functional states of proteins and proteomes. I propose that the new approach will support the generation of testable molecular hypotheses from global data and the development of new frameworks for the modelling of biological systems.

Building on a unique mass spectrometric approach my lab developed, which captures protein structural changes on a proteome-wide scale, we will assess the performance of the global structural readout at analyzing complex phenotypes. We will apply it to a biomedical problem of interest to my lab: the functional and pathological implications of protein aggregates or superassemblies (SAs).

Protein aggregates form not only during disease but also under physiological conditions. These structures regulate important normal processes and contribute to cellular architecture. Using the new structural approach, we will identify and characterize networks of novel functional SAs in E. coli, mouse, and human proteomes. We will assess how genomic variation, environment and age modulate protein structures and SA assembly and how SAs are linked to phenotypes. Last, we will translate our approach to a clinical setting and ask whether altered protein structures can serve as biomarkers of disease, specifically Parkinson’s disease and how SAs underlie Parkinson’s subtypes. We will collect the wealth of dynamic structural data generated through this project into an Atlas of Structural Proteome Dynamics and use the data to shed new light on features of the structural proteome.

Wissenschaftliches Gebiet

Programm/Programme

Thema/Themen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

ERC-2019-COG

Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

ERC-COG - Consolidator Grant

Koordinator

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Netto-EU-Beitrag
€ 2 000 000,00
Adresse
Raemistrasse 101
8092 Zuerich
Schweiz

Auf der Karte ansehen
Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Weitere Finanzmittel
€ 0,00

Begünstigte (1)

Diese Seite teilen

Herunterladen

Letzte Aktualisierung: 16 August 2022

Mein Booklet

Permalink: https://cordis.europa.eu/project/id/866004/de

European Union, 2023