Accessing Nucleosomal DNA

Información del proyecto

NucEM

Identificador del acuerdo de subvención: 884331

DOI

10.3030/884331

Fecha de la firma de la CE 18 Septiembre 2020

Fecha de inicio 1 Marzo 2021

Fecha de finalización 28 Febrero 2026

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 100 929,00

Aportación de la UE

€ 2 100 929,00

Coordinado por

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Switzerland

CORDIS proporciona enlaces a los documentos públicos y las publicaciones de los proyectos de los programas marco HORIZONTE.

Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Publicaciones

Peer reviewed articles (16)

A Multicomponent Reaction-Based Platform Opens New Avenues in Aryl Hydrocarbon Receptor Modulation

Autores: Pau Nadal Rodríguez, Frederick Hartung, Marina Pedrola, Seemon Coomar, Alejandro Diaz-Moreno, Anna M. Hätälä, Katharina M. Rolfes, Ismael Sánchez-Vera, Joan Gil, Elies Molins, Antonio Viayna, Alexander Hanzl, Nicolas H. Thomä, Thomas Haarmann-Stemmann, F. Javier Luque, Rodolfo Lavilla, Ouldouz Ghashghaei
Publicado en: ACS Central Science, Edición 11, 2025, Página(s) 629-641, ISSN 2374-7943
Editor: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/acscentsci.5c00194

Pioneer factors: Emerging rules of engagement for transcription factors on chromatinized DNA

Autores: Manuel Carminati, Luca Vecchia, Lisa Stoos, Nicolas H. Thomä
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, Edición 88, 2024, Página(s) 102875, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2024.102875

Design principles for cyclin K molecular glue degraders

Autores: Zuzanna Kozicka, Dakota J. Suchyta, Vivian Focht, Georg Kempf, Georg Petzold, Marius Jentzsch, Charles Zou, Cristina Di Genua, Katherine A. Donovan, Seemon Coomar, Marko Cigler, Cristina Mayor-Ruiz, Jonathan L. Schmid-Burgk, Daniel Häussinger, Georg E. Winter, Eric S. Fischer, Mikołaj Słabicki, Dennis Gillingham, Benjamin L. Ebert & Nicolas H. Thomä
Publicado en: Nature Chemical Biology, 2023, ISSN 1552-4469
Editor: Nature
DOI: 10.1038/s41589-023-01409-z

Cooperation between bHLH transcription factors and histones for DNA access

Autores: "Alicia K Michael # 1 2 , Lisa Stoos # 1 2 , Priya Crosby 3 , Nikolas Eggers 4 , Xinyu Y Nie 5 , Kristina Makasheva 6 , Martina Minnich 7 , Kelly L Healy 8 , Joscha Weiss 1 2 , Georg Kempf 1 , Simone Cavadini 1 , Lukas Kater 1 , Jan Seebacher 1 , Luca Vecchia 1 , Deyasini Chakraborty 1 2 , Luke Isbel 1 , Ralph S Grand 1 , Florian Andersch 7 , Jennifer L Fribourgh 3 , Dirk"
Publicado en: Nature, 2023, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06282-3

A deep dive into degrader-induced protein-protein interfaces

Autores: Pius Galli 1 , Carlos Pla-Prats 1 , Nicolas H Thomä 2
Publicado en: Trends Pharmacol Sci, 2023, ISSN 0165-6147
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tips.2023.02.001

Recognition of the CCT5 di-Glu degron by CRL4DCAF12 is dependent on TRiC assembly

Autores: Carlos Pla-Prats 1 2 , Simone Cavadini 1 , Georg Kempf 1 , Nicolas H Thomä 1
Publicado en: EMBO J ., 2023, ISSN 1460-2075
Editor: Embo Press
DOI: 10.15252/embj.2022112253

Niclosamide: CRL4^AMBRA1 mediated degradation of cyclin D1 following mitochondrial membrane depolarization

Autores: Seemon Coomar, Jessica A. Gasser, Mikołaj Słabicki, Katherine A. Donovan, Eric S. Fischer, Benjamin L. Ebert, Dennis Gillingham, Nicolas H. Thomä
Publicado en: RSC Medicinal Chemistry, Edición 16, 2025, Página(s) 3049-3057, ISSN 2632-8682
Editor: RSC Medicinal Chemistry
DOI: 10.1039/d5md00054h

Rational Design of CDK12/13 and BRD4 Molecular Glue Degraders

Autores: Zhe Zhuang, Woong Sub Byun, Zuzanna Kozicka, Katherine A. Donovan, Brendan G. Dwyer, Abby M. Thornhill, Hannah M. Jones, Zixuan Jiang, Xijun Zhu, Eric S. Fischer, Nicolas H. Thomä, Nathanael S. Gray
Publicado en: Angewandte Chemie International Edition, Edición 64, 2025, ISSN 1433-7851
Editor: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202508427

Quality control of protein complex assembly by the ubiquitin-proteasome system

Autores: Carlos Pla-Prats, Nicolas H Thomä
Publicado en: Trends Cell Biol, 2022, ISSN 0962-8924
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tcb.2022.02.005

Primed for degradation: How weak protein interactions enable molecular glue degraders

Autores: Alexander Hanzl, Clara Inghelram, Stefan Schmitt, Nicolas H. Thomä
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, Edición 92, 2025, Página(s) 103052, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2025.103052

Reading the chromatinized genome

Autores: Alicia K Michael, Nicolas H Thomä
Publicado en: Cell, 2021, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2021.05.029

UBR5 forms ligand-dependent complexes on chromatin to regulate nuclear hormone receptor stability

Autores: Jonathan M Tsai 1 , Jacob D Aguirre 2 , Yen-Der Li 3 , Jared Brown 4 , Vivian Focht 2 , Lukas Kater 2 , Georg Kempf 2 , Brittany Sandoval 5 , Stefan Schmitt 2 , Justine C Rutter 5 , Pius Galli 6 , Colby R Sandate 2 , Jevon A Cutler 7 , Charles Zou 5 , Katherine A Donovan 8 , Ryan J Lumpkin 8 , Simone Cavadini 2 , Paul M C Park 5 , Quinlan Sievers 5 , Charlie Hatton 7 , Elizabet
Publicado en: Mol. cell, 2023, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.06.028

Nucleosomes specify co-factor access to p53

Autores: Deyasini Chakraborty, Colby R. Sandate, Luke Isbel, Georg Kempf, Joscha Weiss, Simone Cavadini, Lukas Kater, Jan Seebacher, Zuzanna Kozicka, Lisa Stoos, Ralph S. Grand, Dirk Schübeler, Alicia K. Michael, Nicolas H. Thomä
Publicado en: Molecular Cell, Edición 85, 2025, Página(s) 2919-2936.e12, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2025.06.027

Orphan quality control shapes network dynamics and gene expression

Autores: Kevin G Mark 1 , SriDurgaDevi Kolla 1 , Jacob D Aguirre 2 , Danielle M Garshott 1 , Stefan Schmitt 2 , Diane L Haakonsen 3 , Christina Xu 1 , Lukas Kater 2 , Georg Kempf 2 , Brenda Martínez-González 1 , David Akopian 1 , Stephanie K See 4 , Nicolas H Thomä 5 , Michael Rapé 6
Publicado en: Cell, 2023, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.06.015

DCAF1-based PROTACs with activity against clinically validated targets overcoming intrinsic- and acquired-degrader resistance

Autores: Martin Schröder, Martin Renatus, Xiaoyou Liang, Fabian Meili, Thomas Zoller, Sandrine Ferrand, Francois Gauter, Xiaoyan Li, Frederic Sigoillot, Scott Gleim, Therese-Marie Stachyra, Jason R. Thomas, Damien Begue, Maryam Khoshouei, Peggy Lefeuvre, Rita Andraos-Rey, BoYee Chung, Renate Ma, Benika Pinch, Andreas Hofmann, Markus Schirle, Niko Schmiedeberg, Patricia Imbach, Delphine Gorses, Keith Calki
Publicado en: Nature Communications, Edición 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-44237-4

Readout of histone methylation by Trim24 locally restricts chromatin opening by p53

Autores: Luke Isbel 1 2 , Murat Iskar 1 , Sevi Durdu 1 , Joscha Weiss 1 3 , Ralph S Grand 1 4 , Eric Hietter-Pfeiffer 1 3 , Zuzanna Kozicka 1 3 , Alicia K Michael 1 5 , Lukas Burger 1 6 , Nicolas H Thomä 1 , Dirk Schübeler 7 8
Publicado en: Nat Struct Mol Biol, 2023, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01021-8