Accessing Nucleosomal DNA

Informacje na temat projektu

NucEM

Identyfikator umowy o grant: 884331

DOI

10.3030/884331

Data podpisania przez KE 18 Września 2020

Data rozpoczęcia 1 Marca 2021

Data zakończenia 28 Lutego 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 100 929,00

Wkład UE

€ 2 100 929,00

Koordynowany przez

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Switzerland

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (16)

A Multicomponent Reaction-Based Platform Opens New Avenues in Aryl Hydrocarbon Receptor Modulation

Autorzy: Pau Nadal Rodríguez, Frederick Hartung, Marina Pedrola, Seemon Coomar, Alejandro Diaz-Moreno, Anna M. Hätälä, Katharina M. Rolfes, Ismael Sánchez-Vera, Joan Gil, Elies Molins, Antonio Viayna, Alexander Hanzl, Nicolas H. Thomä, Thomas Haarmann-Stemmann, F. Javier Luque, Rodolfo Lavilla, Ouldouz Ghashghaei
Opublikowane w: ACS Central Science, Numer 11, 2025, Strona(/y) 629-641, ISSN 2374-7943
Wydawca: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/acscentsci.5c00194

Pioneer factors: Emerging rules of engagement for transcription factors on chromatinized DNA

Autorzy: Manuel Carminati, Luca Vecchia, Lisa Stoos, Nicolas H. Thomä
Opublikowane w: Current Opinion in Structural Biology, Numer 88, 2024, Strona(/y) 102875, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2024.102875

Design principles for cyclin K molecular glue degraders

Autorzy: Zuzanna Kozicka, Dakota J. Suchyta, Vivian Focht, Georg Kempf, Georg Petzold, Marius Jentzsch, Charles Zou, Cristina Di Genua, Katherine A. Donovan, Seemon Coomar, Marko Cigler, Cristina Mayor-Ruiz, Jonathan L. Schmid-Burgk, Daniel Häussinger, Georg E. Winter, Eric S. Fischer, Mikołaj Słabicki, Dennis Gillingham, Benjamin L. Ebert & Nicolas H. Thomä
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, 2023, ISSN 1552-4469
Wydawca: Nature
DOI: 10.1038/s41589-023-01409-z

Cooperation between bHLH transcription factors and histones for DNA access

Autorzy: "Alicia K Michael # 1 2 , Lisa Stoos # 1 2 , Priya Crosby 3 , Nikolas Eggers 4 , Xinyu Y Nie 5 , Kristina Makasheva 6 , Martina Minnich 7 , Kelly L Healy 8 , Joscha Weiss 1 2 , Georg Kempf 1 , Simone Cavadini 1 , Lukas Kater 1 , Jan Seebacher 1 , Luca Vecchia 1 , Deyasini Chakraborty 1 2 , Luke Isbel 1 , Ralph S Grand 1 , Florian Andersch 7 , Jennifer L Fribourgh 3 , Dirk"
Opublikowane w: Nature, 2023, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06282-3

A deep dive into degrader-induced protein-protein interfaces

Autorzy: Pius Galli 1 , Carlos Pla-Prats 1 , Nicolas H Thomä 2
Opublikowane w: Trends Pharmacol Sci, 2023, ISSN 0165-6147
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tips.2023.02.001

Recognition of the CCT5 di-Glu degron by CRL4DCAF12 is dependent on TRiC assembly

Autorzy: Carlos Pla-Prats 1 2 , Simone Cavadini 1 , Georg Kempf 1 , Nicolas H Thomä 1
Opublikowane w: EMBO J ., 2023, ISSN 1460-2075
Wydawca: Embo Press
DOI: 10.15252/embj.2022112253

Niclosamide: CRL4^AMBRA1 mediated degradation of cyclin D1 following mitochondrial membrane depolarization

Autorzy: Seemon Coomar, Jessica A. Gasser, Mikołaj Słabicki, Katherine A. Donovan, Eric S. Fischer, Benjamin L. Ebert, Dennis Gillingham, Nicolas H. Thomä
Opublikowane w: RSC Medicinal Chemistry, Numer 16, 2025, Strona(/y) 3049-3057, ISSN 2632-8682
Wydawca: RSC Medicinal Chemistry
DOI: 10.1039/d5md00054h

Rational Design of CDK12/13 and BRD4 Molecular Glue Degraders

Autorzy: Zhe Zhuang, Woong Sub Byun, Zuzanna Kozicka, Katherine A. Donovan, Brendan G. Dwyer, Abby M. Thornhill, Hannah M. Jones, Zixuan Jiang, Xijun Zhu, Eric S. Fischer, Nicolas H. Thomä, Nathanael S. Gray
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, Numer 64, 2025, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202508427

Quality control of protein complex assembly by the ubiquitin-proteasome system

Autorzy: Carlos Pla-Prats, Nicolas H Thomä
Opublikowane w: Trends Cell Biol, 2022, ISSN 0962-8924
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tcb.2022.02.005

Primed for degradation: How weak protein interactions enable molecular glue degraders

Autorzy: Alexander Hanzl, Clara Inghelram, Stefan Schmitt, Nicolas H. Thomä
Opublikowane w: Current Opinion in Structural Biology, Numer 92, 2025, Strona(/y) 103052, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2025.103052

Reading the chromatinized genome

Autorzy: Alicia K Michael, Nicolas H Thomä
Opublikowane w: Cell, 2021, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2021.05.029

UBR5 forms ligand-dependent complexes on chromatin to regulate nuclear hormone receptor stability

Autorzy: Jonathan M Tsai 1 , Jacob D Aguirre 2 , Yen-Der Li 3 , Jared Brown 4 , Vivian Focht 2 , Lukas Kater 2 , Georg Kempf 2 , Brittany Sandoval 5 , Stefan Schmitt 2 , Justine C Rutter 5 , Pius Galli 6 , Colby R Sandate 2 , Jevon A Cutler 7 , Charles Zou 5 , Katherine A Donovan 8 , Ryan J Lumpkin 8 , Simone Cavadini 2 , Paul M C Park 5 , Quinlan Sievers 5 , Charlie Hatton 7 , Elizabet
Opublikowane w: Mol. cell, 2023, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.06.028

Nucleosomes specify co-factor access to p53

Autorzy: Deyasini Chakraborty, Colby R. Sandate, Luke Isbel, Georg Kempf, Joscha Weiss, Simone Cavadini, Lukas Kater, Jan Seebacher, Zuzanna Kozicka, Lisa Stoos, Ralph S. Grand, Dirk Schübeler, Alicia K. Michael, Nicolas H. Thomä
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 85, 2025, Strona(/y) 2919-2936.e12, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2025.06.027

Orphan quality control shapes network dynamics and gene expression

Autorzy: Kevin G Mark 1 , SriDurgaDevi Kolla 1 , Jacob D Aguirre 2 , Danielle M Garshott 1 , Stefan Schmitt 2 , Diane L Haakonsen 3 , Christina Xu 1 , Lukas Kater 2 , Georg Kempf 2 , Brenda Martínez-González 1 , David Akopian 1 , Stephanie K See 4 , Nicolas H Thomä 5 , Michael Rapé 6
Opublikowane w: Cell, 2023, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.06.015

DCAF1-based PROTACs with activity against clinically validated targets overcoming intrinsic- and acquired-degrader resistance

Autorzy: Martin Schröder, Martin Renatus, Xiaoyou Liang, Fabian Meili, Thomas Zoller, Sandrine Ferrand, Francois Gauter, Xiaoyan Li, Frederic Sigoillot, Scott Gleim, Therese-Marie Stachyra, Jason R. Thomas, Damien Begue, Maryam Khoshouei, Peggy Lefeuvre, Rita Andraos-Rey, BoYee Chung, Renate Ma, Benika Pinch, Andreas Hofmann, Markus Schirle, Niko Schmiedeberg, Patricia Imbach, Delphine Gorses, Keith Calki
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-44237-4

Readout of histone methylation by Trim24 locally restricts chromatin opening by p53

Autorzy: Luke Isbel 1 2 , Murat Iskar 1 , Sevi Durdu 1 , Joscha Weiss 1 3 , Ralph S Grand 1 4 , Eric Hietter-Pfeiffer 1 3 , Zuzanna Kozicka 1 3 , Alicia K Michael 1 5 , Lukas Burger 1 6 , Nicolas H Thomä 1 , Dirk Schübeler 7 8
Opublikowane w: Nat Struct Mol Biol, 2023, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01021-8