Biophysics in gene regulation - A genome wide approach

Informazioni relative al progetto

BIGGER

ID dell’accordo di sovvenzione: 885360

DOI

10.3030/885360

Data della firma CE 29 Aprile 2020

Data di avvio 1 Gennaio 2021

Data di completamento 31 Dicembre 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 441 410,00

Contributo UE

€ 2 411 410,00

Coordinato da

UPPSALA UNIVERSITET
Sweden

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (5)

Real-time single-molecule 3D tracking in E. coli based on cross-entropy minimization

Autori: Elias Amselem, Bo Broadwater, Tora Hävermark, Magnus Johansson & Johan Elf
Pubblicato in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-36879-1

Pooled optical screening in bacteria using chromosomally expressed barcodes

Autori: Ruben R. G. Soares, Daniela A. García-Soriano, Jimmy Larsson, David Fange, Dvir Schirman, Marco Grillo, Anna Knöppel, Beer Chakra Sen, Fabian Svahn, Spartak Zikrin, Michael Ratz, Mats Nilsson, Johan Elf
Pubblicato in: Communications Biology, Numero 8, 2025, ISSN 2399-3642
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-025-08268-5

Regulatory elements coordinating initiation of chromosome replication to the Escherichia coli cell cycle

Autori: Anna Knöppel, Oscar Broström, Konrad Gras, Johan Elf, David Fange
Pubblicato in: PNAS, 2023, ISSN 1091-6490
Editore: National Academy of Science
DOI: 10.1073/pnas.2213795120

Three-dimensional localization and tracking of chromosomal loci throughout the Escherichia coli cell cycle

Autori: Praneeth Karempudi, Konrad Gras, Elias Amselem, Spartak Zikrin, Dvir Schirman, Johan Elf
Pubblicato in: Communications Biology, Numero 7, 2024, ISSN 2399-3642
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-024-07155-9

The Escherichia coli chromosome moves to the replisome

Autori: Konrad Gras, David Fange, Johan Elf
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-50047-z

Other (2)

Three-dimensional localization of fluorescent proteins in living Escherichia coli

Autori: Praneeth Karempudi, Konrad Gras, Elias Amselem, Spartak Zikrin, Johan Elf
Pubblicato in: bioRxiv, Numero Posted October 21, 2023., 2023
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.10.20.563292

The spatial organization of replication is determined by cell size independently of chromosome copy number

Autori: Anna Knöppel, Oscar Broström, Konrad Gras, David Fange, and Johan Elf
Pubblicato in: 2021
Editore: BioRxiv
DOI: 10.1101/2021.10.11.463968