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APC/C substrates: how are they disengaged from their non-degraded binding partners?

Projektbeschreibung

Die molekularen Mechanismen der Zellteilung

Bei der Mitose werden Schwesterchromatiden von jedem Chromosom auf zwei neu gebildete Tochterzellen gleich verteilt. Der Proteinkomplex APC/C fördert den Übergang zur Anaphase, indem er die Regulatorproteine des Zellzyklus für den Abbau markiert, und sorgt so für Genomstabilität und eine fehlerfreie Teilung. Das Ziel des EU-finanzierten Projekts UbiBranch ist es, die molekularen Mechanismen zu entschlüsseln, mit denen APC/C funktioniert. Mit einem multidisziplinären Ansatz aus Molekularbiologie, Proteomik und In-vivo-Zellbiologie wird das Forschungsteam die Steuerungswirkung von APC/C auf seine verschiedenen Substrate untersuchen. So sollen neue Angriffspunkte mit potenziell therapeutischem Wert gefunden werden.

Ziel

The anaphase promoting complex/ cyclosome (APC/C) is an E3 ubiquitin ligase that controls the cell division cycle by targeting main cell cycle regulators for proteasomal degradation, thereby ensuring error-free cell division and safeguarding genome stability. Its foremost activity is during cell division, or mitosis, when two sets of sister chromatids are equally divided over two newly formed daughter cells.
Intriguingly, APC/C substrates that are degraded at the metaphase-to-anaphase transition have binding partners, which are not degraded. It remains a mystery how the APC/C controls degradation of the substrates and leaves the binding partners undisturbed. My objective is to clarify the molecular mechanism of substrate-binding partner disengagement, and determine the impact of disengagement on substrate degradation, to ensure controlled sister chromatid separation and genome integrity. First, I propose to identify the precise timing of disengagement during the process of ubiquitination, at the molecular level: this will give fundamental insight into disengagement control (Objective 1). Next, I will study ubiquitination at the proteomics level, by unraveling how Lysine-choice, and ubiquitin chain topology affect disengagement (Objective 2). Finally, I will combine conventional molecular biology methods with advanced microscopy techniques to investigate the importance of controlled substrate-binding partner disengagement for substrate degradation and genome stability (Objective 3).
I will employ a multi-disciplinary approach, combining molecular biology, proteomics, and in vivo cell biology approaches to resolve this fundamental biological question. The identified mechanism may provide insights into ternary complex formation of the APC/C and its substrates, which will enable translation to develop targeted-protein-degradation drugs.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

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Koordinator

ACADEMISCH ZIEKENHUIS LEIDEN
Netto-EU-Beitrag
€ 187 572,48
Adresse
ALBINUSDREEF 2
2333 ZA Leiden
Niederlande

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Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
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Gesamtkosten
€ 187 572,48