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The protein archive: preservation potential of ancient human diets and diseases.

Descrizione del progetto

L’interazione proteina-minerale nella conservazione degli archivi proteici

Il DNA e le proteine potrebbero essere prelevati da sedimenti e da artefatti archeologici grazie alla recente scoperta dei sequenziamenti di peptidi in proteine di gusci d’uovo risalenti a 3,8 milioni di anni fa, quindi che perdurano oltre i lipidi o il DNA e che consentono l’identificazione di organismi e di tessuti specifici. Il progetto ProArc, finanziato dall’UE, si propone di studiare l’interazione proteina-minerale e le condizioni conservative ambientali di biomolecole assorbite in campioni archeologici e di altri fossili. Gli obiettivi sono quantificare l’energia libera di Gibbs e i parametri dei legami cinetici di interazioni proteina-minerale in vitro, analizzare la natura, la frazione e la stabilità dei legami interattivi in associazioni proteina-minerale in vitro e sviluppare un modello concettuale per le caratteristiche e la longevità di diversi sistemi proteina-minerale.

Obiettivo

DNA and proteins are now almost routinely being retrieved from sediments and archaeological artefacts. Despite the realization that adsorption of DNA molecules onto the surfaces of minerals can significantly decrease the DNA and protein decay rate, the longevity of mineral bound biomolecules is a still-standing frontier. Recently it was shown that peptide sequences in eggshell proteins persist to 3.8 Ma in Africa, implying that protein sequences will span the whole of human history in all parts of the world. Ancient protein sequences, therefore, persist beyond the lipid or DNA sequence and can be used to identify organisms (ZooMS), identify specific tissues, sex individuals, and identify tissue responses to disease. Understanding the protein-mineral interaction and environmental preservative conditions of adsorbed biomolecules – proteins can thus allow us to a) target such environments for paleoecological and palaeogenetic studies and; b) serve as a quantitative tool for assessing protein sequence migration i.e. ancient microbial communities.
To date, we only have a qualitative idea of how solution composition affects the protein-mineral adsorption/desorption at the bulk level, and we have no quantitative insight into the single bond level energetics as well as the nature and fraction of the interacting bonds. With ProArc I will: a) assess the proteins preservation state in archaeological samples like calculus and ceramics and other fossil samples. I will also: (b) quantify the Gibbs free energy (ΔGbu) and kinetic bond parameters of in vitro protein-mineral interactions; and (c) examine the nature, fraction and stability of interacting bonds of in vitro protein-mineral associations at the bulk level. (d) Finally, I will make a conceptual model for addressing the characteristics and longevity of different protein-mineral systems.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2019

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 207 312,00
Indirizzo
NORREGADE 10
1165 KOBENHAVN
Danimarca

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Regione
Danmark Hovedstaden Byen København
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 207 312,00
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