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Resolving spinal cord cell type evolution with single cell sequencing

Projektbeschreibung

Die Evolution des Rückenmarks bei Wirbeltieren

Gehirn und Rückenmark von Wirbeltieren weisen eine einzigartige Vielfalt von Zelltypen und entsprechend komplexe Mechanismen auf, die die Zellen in einem hochentwickelten Netzwerk organisieren. Das Nervensystem der Wirbeltiere hat sich in dieser Form ausgebildet, um die erweiterten sensorischen Reize und die direkte koordinierte Bewegung zu verarbeiten, doch aktuell wird auch die Theorie diskutiert, dass die Duplikation des Gesamtgenoms zu seiner Komplexität beigetragen haben könnte. Das EU-finanzierte Projekt ScLamprey will nun das Rückenmark des Neunauges untersuchen, eines der ersten basalen Wirbeltiere. Das Forschungsteam wird sich vor allem mit den molekularen Mechanismen befassen, die zur Spezifizierung der Rückenmarkszellen führen, sowie mit ihrem evolutionären Hintergrund. Der dabei entstehende Zellatlas wird eine solide Grundlage für zukünftige Studien zur Evolution des Nervensystems von Wirbeltieren sein.

Ziel

The emergence of vertebrates was accompanied by a major increase in nervous system complexity, as a sophisticated brain and spinal cord evolved to process enhanced sensory input and direct co-ordinated motor output. Such complexity is achieved by an increase in cell number, a greater diversity of cell types and sophisticated mechanisms to organise them. Is has long been debated whether the “2R” whole genome duplications, which occurred just before the vertebrate split, contributed to the vertebrate increased complexity. To address this, we will focus on the lamprey spinal cord –a representative of the first branching vertebrates – and relate gene duplication events to the emergence of new neural cell types. Bulk RNA sequencing and developmental studies have started to shed light on neural patterning mechanisms in lamprey, but they do not provide cellular resolution in this complex tissue. This proposal combines traditional molecular methods with cutting-edge single cell mRNA profiling, to explore (1) the cellular diversity of the lamprey spinal cord, (2) the molecular mechanisms that specify those cell types and (3) the evolutionary origins of these mechanisms. First, I will identify marker genes that define specific cell types in lamprey embryonic spinal cord. Second, I will characterise each cell type transcriptional profile at single-cell resolution. Third, I will manipulate pattering signals and assesses the effect on gene expression, particularly on 2R paralogs. Finally, I will compare the lamprey spinal cord to that of other chordates, and relate gene duplication to the evolution of new cell types.
This project will generate a cellular atlas of the lamprey spinal cord, which will be the framework for future studies, and shed light onto whether the 2R genome duplications supported the evolution of vertebrate complexity.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2019

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 224 933,76
Adresse
WELLINGTON SQUARE UNIVERSITY OFFICES
OX1 2JD Oxford
Vereinigtes Königreich

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Region
South East (England) Berkshire, Buckinghamshire and Oxfordshire Oxfordshire
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 224 933,76
Mein Booklet 0 0