Opis projektu
Analiza ewolucji rdzenia kręgowego u kręgowców
Mózg i rdzeń kręgowy u kręgowców charakteryzują się niezrównaną różnorodnością pod względem typów komórek oraz złożonymi mechanizmami, które organizują je w skomplikowaną sieć. Chociaż układ nerwowy kręgowców wyewoluował w odpowiedzi na udoskonalenie ośrodka odbierania bodźców czuciowych i koordynacji ruchowej, obecnie dyskutuje się, czy teoria duplikacji całego genomu przyczyniła się do jego złożoności. W związku z tym w ramach finansowanego ze środków UE projektu ScLamprey badaniu poddany zostanie rdzeń kręgowy minoga, jednego z pierwszych kręgowców. Naukowcy skupią się na mechanizmach molekularnych, które prowadzą do wyszczególnienia komórek rdzenia kręgowego, oraz ich ewolucyjnym pochodzeniu. Powstały atlas komórkowy posłuży za podstawę dla przyszłych badań nad ewolucją układu nerwowego u kręgowców.
Cel
The emergence of vertebrates was accompanied by a major increase in nervous system complexity, as a sophisticated brain and spinal cord evolved to process enhanced sensory input and direct co-ordinated motor output. Such complexity is achieved by an increase in cell number, a greater diversity of cell types and sophisticated mechanisms to organise them. Is has long been debated whether the 2R whole genome duplications, which occurred just before the vertebrate split, contributed to the vertebrate increased complexity. To address this, we will focus on the lamprey spinal cord a representative of the first branching vertebrates and relate gene duplication events to the emergence of new neural cell types. Bulk RNA sequencing and developmental studies have started to shed light on neural patterning mechanisms in lamprey, but they do not provide cellular resolution in this complex tissue. This proposal combines traditional molecular methods with cutting-edge single cell mRNA profiling, to explore (1) the cellular diversity of the lamprey spinal cord, (2) the molecular mechanisms that specify those cell types and (3) the evolutionary origins of these mechanisms. First, I will identify marker genes that define specific cell types in lamprey embryonic spinal cord. Second, I will characterise each cell type transcriptional profile at single-cell resolution. Third, I will manipulate pattering signals and assesses the effect on gene expression, particularly on 2R paralogs. Finally, I will compare the lamprey spinal cord to that of other chordates, and relate gene duplication to the evolution of new cell types.
This project will generate a cellular atlas of the lamprey spinal cord, which will be the framework for future studies, and shed light onto whether the 2R genome duplications supported the evolution of vertebrate complexity.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
OX1 2JD Oxford
Zjednoczone Królestwo