Descrizione del progetto DEENESFRITPL Perché una pianta di pepe è resistente alle malattie Il Piper colubrinum, utilizzato per curare la pododermatite, è un parente selvatico delle specie coltivate di pepe nero, il Piper nigrum. Mentre il Piper colubrinum è resistente alla malattia, il Piper nigrum (una pregiata spezia) non lo è. Mancano dati confermati sulle sequenze genomiche di entrambe le specie. Inoltre, la ragione esatta della resistenza del Piper colubrinum non è stata ancora chiarita. Per trovare le risposte a tali quesiti, il progetto OCNANO finanziato dall’UE utilizzerà un dispositivo portatile in tempo reale chiamato MinION per il sequenziamento del DNA e dell’RNA. Nello specifico, il dispositivo annoterà i trascrittomi di entrambe le specie di pepe, utilizzando inoltre una cattura basata su array per individuare l’espressione genica dell’agente patogeno durante l’infezione. Il progetto metterà anche a confronto l’analisi dell’espressione genica del Piper nigrum e del Piper colubrinum durante l’infezione. Mostra l’obiettivo del progetto Nascondi l’obiettivo del progetto Obiettivo Modern agriculture is dominated by crops noticeable for intense food supply leaving behind a class of neglected or orphan crops. Relatively poorly studied orphan crops have the potential to diversify the human diet, increase agricultural food productivity levels and enable more sustainable and resilient agro- and horti-food systems. Here, we focus on two such crops-Piper nigrum (black pepper) the most important spice traded internationally and Piper colubrinum, a wild relative of black pepper introduced from Brazil, which is the only known source of resistance to diseases such as foot rot or quick wilt caused by an Oomycete Phytophthora capsici. Negligible genome sequence data exists for either species. Although agricultural practices for making P. nigrum resistant to this Oomycete by interspecific hybridization with P.colubrinum are well known, no effective strategies have been generated yet. The exact reason behind the resistance of P.colubrinum is not yet understood, thus leaving open a fertile area of investigation.With this background, OCNANO aims to reveal the basis of pathogen resistance that distinguish resistant from susceptible species of Piper. We will employ Oxford nanopore MinION technology to address this issue with three specific objectives:(1) Annotate the transcriptomes of P.nigrum and P. colubrinum; (2) Identify pathogen gene expression during infection using a capture array; (3) Comparative analysis of P. nigrum and P. colubrinum gene expression during infection. Innovative strategies like nanopore in combination with other sequencing approaches can transform annotation and enable the richest understanding of gene expression during pathogen attack. Research progressing towards the rescue of such orphan crops from their environmental stresses, by applying leading edge technologies, can further enhance crop productivity, food security, knowledge based economy and society and contribute to the achievement of several UN Sustainable Development Goals. Campo scientifico scienze socialieconomia e commercioscienze economicheeconomia della produzioneproduttivitàscienze mediche e della salutescienze della salutenutrizionescienze agricoleagricoltura, silvicoltura e pescaagricolturascienze naturaliscienze biologichegeneticagenomi Programma(i) H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions Main Programme H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility Argomento(i) MSCA-IF-2019 - Individual Fellowships Invito a presentare proposte H2020-MSCA-IF-2019 Vedi altri progetti per questo bando Meccanismo di finanziamento MSCA-IF-EF-ST - Standard EF Coordinatore UNIVERSITY OF DUNDEE Contribution nette de l'UE € 224 933,76 Indirizzo Nethergate DD1 4HN Dundee Regno Unito Mostra sulla mappa Regione Scotland Eastern Scotland Angus and Dundee City Tipo di attività Higher or Secondary Education Establishments Collegamenti Contatta l’organizzazione Opens in new window Sito web Opens in new window Partecipazione a programmi di R&I dell'UE Opens in new window Rete di collaborazione HORIZON Opens in new window Altri finanziamenti € 0,00
