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Deciphering the evolution and roles of cytosine DNA methylation across eukaryotes

CORDIS proporciona enlaces a los documentos públicos y las publicaciones de los proyectos de los programas marco HORIZONTE.

Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Publicaciones

Annelid methylomes reveal ancestral developmental and aging-associated epigenetic erosion across Bilateria (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Kero Guynes, Luke A. Sarre, Allan M. Carrillo-Baltodano, Billie E. Davies, Lan Xu, Yan Liang, Francisco M. Martín-Zamora, Paul J. Hurd, Alex de Mendoza, José M. Martín-Durán
Publicado en: Genome Biology, Edición 25, 2024, ISSN 1474-760X
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-024-03346-z

Reconstructing the last common ancestor of all eukaryotes (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Thomas A. Richards, Laura Eme, John M. Archibald, Guy Leonard, Susana M. Coelho, Alex de Mendoza, Christophe Dessimoz, Pavel Dolezal, Lillian K. Fritz-Laylin, Toni Gabaldón, Vladimír Hampl, Geert J. P. L. Kops, Michelle M. Leger, Purificacion Lopez-Garcia, James O. McInerney, David Moreira, Sergio A. Muñoz-Gómez, Daniel J. Richter, Iñaki Ruiz-Trillo, Alyson E. Santoro, Arnau Sebé-Pedrós, Be
Publicado en: PLOS Biology, Edición 22, 2024, Página(s) e3002917, ISSN 1545-7885
Editor: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002917

The genomic origin of the unique chaetognath body plan (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Laura Piovani, Daria Gavriouchkina, Elise Parey, Luke A. Sarre, Katja T. C. A. Peijnenburg, José María Martín-Durán, Daniel S. Rokhsar, Noriyuki Satoh, Alex de Mendoza, Taichiro Goto, Ferdinand Marlétaz
Publicado en: Nature, Edición 645, 2025, Página(s) 964-973, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-09403-2

Chromatin loops are an ancestral hallmark of the animal regulatory genome (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Iana V. Kim, Cristina Navarrete, Xavier Grau-Bové, Marta Iglesias, Anamaria Elek, Grygoriy Zolotarov, Nikolai S. Bykov, Sean A. Montgomery, Ewa Ksiezopolska, Didac Cañas-Armenteros, Joan J. Soto-Angel, Sally P. Leys, Pawel Burkhardt, Hiroshi Suga, Alex de Mendoza, Marc A. Marti-Renom, Arnau Sebé-Pedrós
Publicado en: Nature, Edición 642, 2025, Página(s) 1097-1105, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-08960-w

Specific DNMT3C flanking sequence preferences facilitate methylation of young murine retrotransposons (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Leonie Dossmann, Max Emperle, Michael Dukatz, Alex de Mendoza, Pavel Bashtrykov, Albert Jeltsch
Publicado en: Communications Biology, Edición 7, 2024, ISSN 2399-3642
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-024-06252-z

Repressive Cytosine Methylation is a Marker of Viral Gene Transfer Across Divergent Eukaryotes (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Luke A Sarre, Giselle Azucena Gastellou Peralta, Pedro Romero Charria, Vladimir Ovchinnikov, Alex de Mendoza
Publicado en: Molecular Biology and Evolution, Edición 42, 2025, ISSN 0737-4038
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msaf176

Epigenetic silencing and genome dynamics determine the fate of giant virus endogenizations in Acanthamoeba (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Cédric Blais, Morgan J. Colp, Luke A. Sarre, Alex de Mendoza, John M. Archibald
Publicado en: BMC Biology, Edición 23, 2025, ISSN 1741-7007
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-025-02280-1

DNA methylation enables recurrent endogenization of giant viruses in an animal relative (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Luke A. Sarre, Iana V. Kim, Vladimir Ovchinnikov, Marine Olivetta, Hiroshi Suga, Omaya Dudin, Arnau Sebé-Pedrós, Alex de Mendoza
Publicado en: Science Advances, Edición 10, 2024, ISSN 2375-2548
Editor: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.ado6406

The emergence of Sox and POU transcription factors predates the origins of animal stem cells (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Ya Gao, Daisylyn Senna Tan, Mathias Girbig, Haoqing Hu, Xiaomin Zhou, Qianwen Xie, Shi Wing Yeung, Kin Shing Lee, Sik Yin Ho, Vlad Cojocaru, Jian Yan, Georg K. A. Hochberg, Alex de Mendoza, Ralf Jauch
Publicado en: Nature Communications, Edición 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-54152-x

Adenine DNA methylation associated with transcriptionally permissive chromatin is widespread across eukaryotes (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Pedro Romero Charria, Cristina Navarrete, Vladimir Ovchinnikov, Lan Xu, Luke A. Sarre, Victoria Shabardina, Ewa Ksiezopolska, Elena Casacuberta, David Lara-Astiaso, Arnau Sebé-Pedrós, Alex de Mendoza
Publicado en: Nature Genetics, Edición 57, 2025, Página(s) 3126-3136, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-025-02409-6

Genome synteny reveals hidden enhancer conservation (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Alex de Mendoza
Publicado en: Nature Genetics, Edición 57, 2025, Página(s) 1328-1329, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-025-02194-2

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