Deciphering the evolution and roles of cytosine DNA methylation across eukaryotes

Informacje na temat projektu

METHYLEVOL

Identyfikator umowy o grant: 950230

DOI

10.3030/950230

Data podpisania przez KE 20 Października 2020

Data rozpoczęcia 1 Września 2021

Data zakończenia 31 Grudnia 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 499 965,00

Wkład UE

€ 1 499 965,00

Koordynowany przez

QUEEN MARY UNIVERSITY OF LONDON
United Kingdom

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (10)

Annelid methylomes reveal ancestral developmental and aging-associated epigenetic erosion across Bilateria

Autorzy: Kero Guynes, Luke A. Sarre, Allan M. Carrillo-Baltodano, Billie E. Davies, Lan Xu, Yan Liang, Francisco M. Martín-Zamora, Paul J. Hurd, Alex de Mendoza, José M. Martín-Durán
Opublikowane w: Genome Biology, Numer 25, 2024, ISSN 1474-760X
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-024-03346-z

Reconstructing the last common ancestor of all eukaryotes

Autorzy: Thomas A. Richards, Laura Eme, John M. Archibald, Guy Leonard, Susana M. Coelho, Alex de Mendoza, Christophe Dessimoz, Pavel Dolezal, Lillian K. Fritz-Laylin, Toni Gabaldón, Vladimír Hampl, Geert J. P. L. Kops, Michelle M. Leger, Purificacion Lopez-Garcia, James O. McInerney, David Moreira, Sergio A. Muñoz-Gómez, Daniel J. Richter, Iñaki Ruiz-Trillo, Alyson E. Santoro, Arnau Sebé-Pedrós, Be
Opublikowane w: PLOS Biology, Numer 22, 2024, Strona(/y) e3002917, ISSN 1545-7885
Wydawca: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002917

The genomic origin of the unique chaetognath body plan

Autorzy: Laura Piovani, Daria Gavriouchkina, Elise Parey, Luke A. Sarre, Katja T. C. A. Peijnenburg, José María Martín-Durán, Daniel S. Rokhsar, Noriyuki Satoh, Alex de Mendoza, Taichiro Goto, Ferdinand Marlétaz
Opublikowane w: Nature, Numer 645, 2025, Strona(/y) 964-973, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-09403-2

Chromatin loops are an ancestral hallmark of the animal regulatory genome

Autorzy: Iana V. Kim, Cristina Navarrete, Xavier Grau-Bové, Marta Iglesias, Anamaria Elek, Grygoriy Zolotarov, Nikolai S. Bykov, Sean A. Montgomery, Ewa Ksiezopolska, Didac Cañas-Armenteros, Joan J. Soto-Angel, Sally P. Leys, Pawel Burkhardt, Hiroshi Suga, Alex de Mendoza, Marc A. Marti-Renom, Arnau Sebé-Pedrós
Opublikowane w: Nature, Numer 642, 2025, Strona(/y) 1097-1105, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-08960-w

Specific DNMT3C flanking sequence preferences facilitate methylation of young murine retrotransposons

Autorzy: Leonie Dossmann, Max Emperle, Michael Dukatz, Alex de Mendoza, Pavel Bashtrykov, Albert Jeltsch
Opublikowane w: Communications Biology, Numer 7, 2024, ISSN 2399-3642
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-024-06252-z

Repressive Cytosine Methylation is a Marker of Viral Gene Transfer Across Divergent Eukaryotes

Autorzy: Luke A Sarre, Giselle Azucena Gastellou Peralta, Pedro Romero Charria, Vladimir Ovchinnikov, Alex de Mendoza
Opublikowane w: Molecular Biology and Evolution, Numer 42, 2025, ISSN 0737-4038
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msaf176

Epigenetic silencing and genome dynamics determine the fate of giant virus endogenizations in Acanthamoeba

Autorzy: Cédric Blais, Morgan J. Colp, Luke A. Sarre, Alex de Mendoza, John M. Archibald
Opublikowane w: BMC Biology, Numer 23, 2025, ISSN 1741-7007
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-025-02280-1

DNA methylation enables recurrent endogenization of giant viruses in an animal relative

Autorzy: Luke A. Sarre, Iana V. Kim, Vladimir Ovchinnikov, Marine Olivetta, Hiroshi Suga, Omaya Dudin, Arnau Sebé-Pedrós, Alex de Mendoza
Opublikowane w: Science Advances, Numer 10, 2024, ISSN 2375-2548
Wydawca: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.ado6406

The emergence of Sox and POU transcription factors predates the origins of animal stem cells

Autorzy: Ya Gao, Daisylyn Senna Tan, Mathias Girbig, Haoqing Hu, Xiaomin Zhou, Qianwen Xie, Shi Wing Yeung, Kin Shing Lee, Sik Yin Ho, Vlad Cojocaru, Jian Yan, Georg K. A. Hochberg, Alex de Mendoza, Ralf Jauch
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-54152-x

Adenine DNA methylation associated with transcriptionally permissive chromatin is widespread across eukaryotes

Autorzy: Pedro Romero Charria, Cristina Navarrete, Vladimir Ovchinnikov, Lan Xu, Luke A. Sarre, Victoria Shabardina, Ewa Ksiezopolska, Elena Casacuberta, David Lara-Astiaso, Arnau Sebé-Pedrós, Alex de Mendoza
Opublikowane w: Nature Genetics, Numer 57, 2025, Strona(/y) 3126-3136, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-025-02409-6

Non-peer reviewed articles (1)

Genome synteny reveals hidden enhancer conservation

Autorzy: Alex de Mendoza
Opublikowane w: Nature Genetics, Numer 57, 2025, Strona(/y) 1328-1329, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-025-02194-2