Understanding and predicting PATHOgen COMmunities

Informations projet

PATHOCOM

N° de convention de subvention: 951444

DOI

10.3030/951444

Date de signature de la CE 30 Juin 2021

Date de début 1 Juillet 2021

Date de fin 30 Juin 2028

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 9 945 744,00

Contribution de l’UE

€ 9 945 744,00

Coordonné par

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (14)

The design of mapping populations: Impacts of geographic scale on genetic architecture and mapping efficacy for defense and immunity.

Auteurs: Andrew D. Gloss, Margaret C. Steiner, John Novembre, Joy Bergelson
Publié dans: Current Opinion in Plant Biology, Numéro Volume 74, August 2023, 102399, 2023, ISSN 1369-5266
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2023.102399

The Genetic Architecture of <i>Arabidopsis thaliana</i> in Response to Native Non-Pathogenic Bacterial Species Revealed by Genome-Wide Association Mapping in Field Conditions

Auteurs: Daniela Ramírez-Sánchez, Rémi Duflos, Chrystel Gibelin-Viala, Rémy Zamar, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Publié dans: Phytobiomes Journal, Numéro 8, 2024, Page(s) 556-567, ISSN 2471-2906
Éditeur: Scientific Societies
DOI: 10.1094/pbiomes-01-24-0010-r

Applying ecological principles to microbiome engineering

Auteurs: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Publié dans: Nature Microbiology, 2025, ISSN 2058-5276
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-025-02076-7

The plant immune receptor SNC1 monitors helper NLRs targeted by a bacterial effector

Auteurs: Ming-Yu Wang, Jun-Bin Chen, Rui Wu, Hai-Long Guo, Yan Chen, Zhen-Ju Li, Lu-Yang Wei, Chuang Liu, Sheng-Feng He, Mei-Da Du, Ya-long Guo, You-Liang Peng, Jonathan D.G. Jones, Detlef Weigel, Jian-Hua Huang, Wang-Sheng Zhu
Publié dans: Cell Host &amp; Microbe, Numéro 31, 2024, Page(s) 1792-1803.e7, ISSN 1931-3128
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2023.10.006

The genetic and physiological basis of <i>Arabidopsis thaliana</i> tolerance to <i>Pseudomonas viridiflava</i>

Auteurs: Alejandra Duque‐Jaramillo, Nina Ulmer, Saleh Alseekh, Ilja Bezrukov, Alisdair R. Fernie, Aleksandra Skirycz, Talia L. Karasov, Detlef Weigel
Publié dans: New Phytologist, Numéro 240, 2023, Page(s) 1961-1975, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.19241

Toward Ecologically Relevant Genetics of Interactions Between Host Plants and Plant Growth‐Promoting Bacteria

Auteurs: Rémi Duflos, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Publié dans: Advanced Genetics, Numéro 5, 2024, ISSN 2641-6573
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/ggn2.202300210

Continental-scale associations of Arabidopsis thaliana phyllosphere members with host genotype and drought

Auteurs: Talia L. Karasov, Manuela Neumann, Laura Leventhal, Efthymia Symeonidi, Gautam Shirsekar, Aubrey Hawks, Grey Monroe, null null, A. Cristina Barragán, Ilja Bezrukov, Claudia Friedemann, Alba González Hernando, Anette Habring, Julia Hildebrandt, Sonja Kersten, Patricia Lang, Sergio M. Latorre, Miriam Lucke, Derek S. Lundberg, Ulrich Lutz, Fiona Paul, Fernando A. Rabanal, Julian Regalado, Thanvi Sr
Publié dans: Nature Microbiology, Numéro 9, 2024, Page(s) 2748-2758, ISSN 2058-5276
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-024-01773-z

Genetic architecture of the response of Arabidopsis thaliana to a native plant-growth-promoting bacterial strain

Auteurs: Daniela Ramírez-Sánchez, Chrystel Gibelin-Viala, Fabrice Roux, Fabienne Vailleau
Publié dans: Frontiers in Plant Science, Numéro 14, 2023, ISSN 1664-462X
Éditeur: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2023.1266032

Evolutionary implications of host genetic control for engineering beneficial microbiomes

Auteurs: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Publié dans: Current Opinion in Systems Biology, Numéro Volume 34, June 2023, 100455, 2023, ISSN 2452-3100
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.coisb.2023.100455

Building microbial synthetic communities: get inspired by the design of synthetic plant communities

Auteurs: Paloma Durán, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Publié dans: New Phytologist, Numéro 246, 2025, Page(s) 402-405, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.70011

Spatial metatranscriptomics resolves host–bacteria–fungi interactomes

Auteurs: Sami Saarenpää, Or Shalev, Haim Ashkenazy, Vanessa Carlos, Derek Severi Lundberg, Detlef Weigel, Stefania Giacomello
Publié dans: Nature Biotechnology, Numéro 42, 2024, Page(s) 1384-1393, ISSN 1087-0156
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01979-2

Genome-wide association studies in plant pathosystems: success or failure?

Auteurs: Choghag Demirjian, Fabienne Vailleau, Richard Berthomé, Fabrice Roux
Publié dans: Trends in Plant science, Numéro Volume 28, Numéro 4, April 2023, 2023, Page(s) 471-485, ISSN 1360-1385
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tplants.2022.11.006

The Genetic Architecture of Adaptation to Leaf and Root Bacterial Microbiota in Arabidopsis thaliana

Auteurs: Fabrice Roux, Léa Frachon, Claudia Bartoli
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro Volume 40, Numéro 5, May 2023, msad093, 2023, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msad093

Contrasting patterns of microbial dominance in the Arabidopsis thaliana phyllosphere

Auteurs: Derek S. Lundberg, Roger de Pedro Jové, Pratchaya Pramoj Na Ayutthaya, Talia L. Karasov, Or Shalev, Karin Poersch, Wei Ding, Anita Bollmann-Giolai, Ilja Bezrukov, Detlef Weigel
Publié dans: PNAS, Numéro Vol. 119, No. 52, December 27, 2022, 2022, ISSN 1091-6490
Éditeur: National Academy of Sciences of the United States of America (NAS)
DOI: 10.1073/pnas.2211881119

Other (1)

The relative effects of abiotic and biotic factors in explaining the structure of soil bacterial communities at diverse taxonomic levels

Auteurs: Baptiste Mayjonade, Rémy Zamar, Sébastien Carrere, Fabrice Roux
Publié dans: 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.10.29.620845