Understanding and predicting PATHOgen COMmunities

Informacje na temat projektu

PATHOCOM

Identyfikator umowy o grant: 951444

DOI

10.3030/951444

Data podpisania przez KE 30 Czerwca 2021

Data rozpoczęcia 1 Lipca 2021

Data zakończenia 30 Czerwca 2028

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 9 945 744,00

Wkład UE

€ 9 945 744,00

Koordynowany przez

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (14)

The design of mapping populations: Impacts of geographic scale on genetic architecture and mapping efficacy for defense and immunity.

Autorzy: Andrew D. Gloss, Margaret C. Steiner, John Novembre, Joy Bergelson
Opublikowane w: Current Opinion in Plant Biology, Numer Volume 74, August 2023, 102399, 2023, ISSN 1369-5266
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2023.102399

The Genetic Architecture of <i>Arabidopsis thaliana</i> in Response to Native Non-Pathogenic Bacterial Species Revealed by Genome-Wide Association Mapping in Field Conditions

Autorzy: Daniela Ramírez-Sánchez, Rémi Duflos, Chrystel Gibelin-Viala, Rémy Zamar, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Opublikowane w: Phytobiomes Journal, Numer 8, 2024, Strona(/y) 556-567, ISSN 2471-2906
Wydawca: Scientific Societies
DOI: 10.1094/pbiomes-01-24-0010-r

Applying ecological principles to microbiome engineering

Autorzy: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Opublikowane w: Nature Microbiology, 2025, ISSN 2058-5276
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-025-02076-7

The plant immune receptor SNC1 monitors helper NLRs targeted by a bacterial effector

Autorzy: Ming-Yu Wang, Jun-Bin Chen, Rui Wu, Hai-Long Guo, Yan Chen, Zhen-Ju Li, Lu-Yang Wei, Chuang Liu, Sheng-Feng He, Mei-Da Du, Ya-long Guo, You-Liang Peng, Jonathan D.G. Jones, Detlef Weigel, Jian-Hua Huang, Wang-Sheng Zhu
Opublikowane w: Cell Host &amp; Microbe, Numer 31, 2024, Strona(/y) 1792-1803.e7, ISSN 1931-3128
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2023.10.006

The genetic and physiological basis of <i>Arabidopsis thaliana</i> tolerance to <i>Pseudomonas viridiflava</i>

Autorzy: Alejandra Duque‐Jaramillo, Nina Ulmer, Saleh Alseekh, Ilja Bezrukov, Alisdair R. Fernie, Aleksandra Skirycz, Talia L. Karasov, Detlef Weigel
Opublikowane w: New Phytologist, Numer 240, 2023, Strona(/y) 1961-1975, ISSN 0028-646X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.19241

Toward Ecologically Relevant Genetics of Interactions Between Host Plants and Plant Growth‐Promoting Bacteria

Autorzy: Rémi Duflos, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Opublikowane w: Advanced Genetics, Numer 5, 2024, ISSN 2641-6573
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/ggn2.202300210

Continental-scale associations of Arabidopsis thaliana phyllosphere members with host genotype and drought

Autorzy: Talia L. Karasov, Manuela Neumann, Laura Leventhal, Efthymia Symeonidi, Gautam Shirsekar, Aubrey Hawks, Grey Monroe, null null, A. Cristina Barragán, Ilja Bezrukov, Claudia Friedemann, Alba González Hernando, Anette Habring, Julia Hildebrandt, Sonja Kersten, Patricia Lang, Sergio M. Latorre, Miriam Lucke, Derek S. Lundberg, Ulrich Lutz, Fiona Paul, Fernando A. Rabanal, Julian Regalado, Thanvi Sr
Opublikowane w: Nature Microbiology, Numer 9, 2024, Strona(/y) 2748-2758, ISSN 2058-5276
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-024-01773-z

Genetic architecture of the response of Arabidopsis thaliana to a native plant-growth-promoting bacterial strain

Autorzy: Daniela Ramírez-Sánchez, Chrystel Gibelin-Viala, Fabrice Roux, Fabienne Vailleau
Opublikowane w: Frontiers in Plant Science, Numer 14, 2023, ISSN 1664-462X
Wydawca: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2023.1266032

Evolutionary implications of host genetic control for engineering beneficial microbiomes

Autorzy: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Opublikowane w: Current Opinion in Systems Biology, Numer Volume 34, June 2023, 100455, 2023, ISSN 2452-3100
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.coisb.2023.100455

Building microbial synthetic communities: get inspired by the design of synthetic plant communities

Autorzy: Paloma Durán, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Opublikowane w: New Phytologist, Numer 246, 2025, Strona(/y) 402-405, ISSN 0028-646X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.70011

Spatial metatranscriptomics resolves host–bacteria–fungi interactomes

Autorzy: Sami Saarenpää, Or Shalev, Haim Ashkenazy, Vanessa Carlos, Derek Severi Lundberg, Detlef Weigel, Stefania Giacomello
Opublikowane w: Nature Biotechnology, Numer 42, 2024, Strona(/y) 1384-1393, ISSN 1087-0156
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01979-2

Genome-wide association studies in plant pathosystems: success or failure?

Autorzy: Choghag Demirjian, Fabienne Vailleau, Richard Berthomé, Fabrice Roux
Opublikowane w: Trends in Plant science, Numer Volume 28, Numer 4, April 2023, 2023, Strona(/y) 471-485, ISSN 1360-1385
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tplants.2022.11.006

The Genetic Architecture of Adaptation to Leaf and Root Bacterial Microbiota in Arabidopsis thaliana

Autorzy: Fabrice Roux, Léa Frachon, Claudia Bartoli
Opublikowane w: Molecular Biology and Evolution, Numer Volume 40, Numer 5, May 2023, msad093, 2023, ISSN 0737-4038
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msad093

Contrasting patterns of microbial dominance in the Arabidopsis thaliana phyllosphere

Autorzy: Derek S. Lundberg, Roger de Pedro Jové, Pratchaya Pramoj Na Ayutthaya, Talia L. Karasov, Or Shalev, Karin Poersch, Wei Ding, Anita Bollmann-Giolai, Ilja Bezrukov, Detlef Weigel
Opublikowane w: PNAS, Numer Vol. 119, No. 52, December 27, 2022, 2022, ISSN 1091-6490
Wydawca: National Academy of Sciences of the United States of America (NAS)
DOI: 10.1073/pnas.2211881119

Other (1)

The relative effects of abiotic and biotic factors in explaining the structure of soil bacterial communities at diverse taxonomic levels

Autorzy: Baptiste Mayjonade, Rémy Zamar, Sébastien Carrere, Fabrice Roux
Opublikowane w: 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.10.29.620845