Understanding and predicting PATHOgen COMmunities

Informazioni relative al progetto

PATHOCOM

ID dell’accordo di sovvenzione: 951444

DOI

10.3030/951444

Data della firma CE 30 Giugno 2021

Data di avvio 1 Luglio 2021

Data di completamento 30 Giugno 2028

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 9 945 744,00

Contributo UE

€ 9 945 744,00

Coordinato da

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (14)

The design of mapping populations: Impacts of geographic scale on genetic architecture and mapping efficacy for defense and immunity.

Autori: Andrew D. Gloss, Margaret C. Steiner, John Novembre, Joy Bergelson
Pubblicato in: Current Opinion in Plant Biology, Numero Volume 74, August 2023, 102399, 2023, ISSN 1369-5266
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2023.102399

The Genetic Architecture of <i>Arabidopsis thaliana</i> in Response to Native Non-Pathogenic Bacterial Species Revealed by Genome-Wide Association Mapping in Field Conditions

Autori: Daniela Ramírez-Sánchez, Rémi Duflos, Chrystel Gibelin-Viala, Rémy Zamar, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Pubblicato in: Phytobiomes Journal, Numero 8, 2024, Pagina/e 556-567, ISSN 2471-2906
Editore: Scientific Societies
DOI: 10.1094/pbiomes-01-24-0010-r

Applying ecological principles to microbiome engineering

Autori: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Pubblicato in: Nature Microbiology, 2025, ISSN 2058-5276
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-025-02076-7

The plant immune receptor SNC1 monitors helper NLRs targeted by a bacterial effector

Autori: Ming-Yu Wang, Jun-Bin Chen, Rui Wu, Hai-Long Guo, Yan Chen, Zhen-Ju Li, Lu-Yang Wei, Chuang Liu, Sheng-Feng He, Mei-Da Du, Ya-long Guo, You-Liang Peng, Jonathan D.G. Jones, Detlef Weigel, Jian-Hua Huang, Wang-Sheng Zhu
Pubblicato in: Cell Host &amp; Microbe, Numero 31, 2024, Pagina/e 1792-1803.e7, ISSN 1931-3128
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2023.10.006

The genetic and physiological basis of <i>Arabidopsis thaliana</i> tolerance to <i>Pseudomonas viridiflava</i>

Autori: Alejandra Duque‐Jaramillo, Nina Ulmer, Saleh Alseekh, Ilja Bezrukov, Alisdair R. Fernie, Aleksandra Skirycz, Talia L. Karasov, Detlef Weigel
Pubblicato in: New Phytologist, Numero 240, 2023, Pagina/e 1961-1975, ISSN 0028-646X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.19241

Toward Ecologically Relevant Genetics of Interactions Between Host Plants and Plant Growth‐Promoting Bacteria

Autori: Rémi Duflos, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Pubblicato in: Advanced Genetics, Numero 5, 2024, ISSN 2641-6573
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/ggn2.202300210

Continental-scale associations of Arabidopsis thaliana phyllosphere members with host genotype and drought

Autori: Talia L. Karasov, Manuela Neumann, Laura Leventhal, Efthymia Symeonidi, Gautam Shirsekar, Aubrey Hawks, Grey Monroe, null null, A. Cristina Barragán, Ilja Bezrukov, Claudia Friedemann, Alba González Hernando, Anette Habring, Julia Hildebrandt, Sonja Kersten, Patricia Lang, Sergio M. Latorre, Miriam Lucke, Derek S. Lundberg, Ulrich Lutz, Fiona Paul, Fernando A. Rabanal, Julian Regalado, Thanvi Sr
Pubblicato in: Nature Microbiology, Numero 9, 2024, Pagina/e 2748-2758, ISSN 2058-5276
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-024-01773-z

Genetic architecture of the response of Arabidopsis thaliana to a native plant-growth-promoting bacterial strain

Autori: Daniela Ramírez-Sánchez, Chrystel Gibelin-Viala, Fabrice Roux, Fabienne Vailleau
Pubblicato in: Frontiers in Plant Science, Numero 14, 2023, ISSN 1664-462X
Editore: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2023.1266032

Evolutionary implications of host genetic control for engineering beneficial microbiomes

Autori: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Pubblicato in: Current Opinion in Systems Biology, Numero Volume 34, June 2023, 100455, 2023, ISSN 2452-3100
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.coisb.2023.100455

Building microbial synthetic communities: get inspired by the design of synthetic plant communities

Autori: Paloma Durán, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Pubblicato in: New Phytologist, Numero 246, 2025, Pagina/e 402-405, ISSN 0028-646X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.70011

Spatial metatranscriptomics resolves host–bacteria–fungi interactomes

Autori: Sami Saarenpää, Or Shalev, Haim Ashkenazy, Vanessa Carlos, Derek Severi Lundberg, Detlef Weigel, Stefania Giacomello
Pubblicato in: Nature Biotechnology, Numero 42, 2024, Pagina/e 1384-1393, ISSN 1087-0156
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01979-2

Genome-wide association studies in plant pathosystems: success or failure?

Autori: Choghag Demirjian, Fabienne Vailleau, Richard Berthomé, Fabrice Roux
Pubblicato in: Trends in Plant science, Numero Volume 28, Numero 4, April 2023, 2023, Pagina/e 471-485, ISSN 1360-1385
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tplants.2022.11.006

The Genetic Architecture of Adaptation to Leaf and Root Bacterial Microbiota in Arabidopsis thaliana

Autori: Fabrice Roux, Léa Frachon, Claudia Bartoli
Pubblicato in: Molecular Biology and Evolution, Numero Volume 40, Numero 5, May 2023, msad093, 2023, ISSN 0737-4038
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msad093

Contrasting patterns of microbial dominance in the Arabidopsis thaliana phyllosphere

Autori: Derek S. Lundberg, Roger de Pedro Jové, Pratchaya Pramoj Na Ayutthaya, Talia L. Karasov, Or Shalev, Karin Poersch, Wei Ding, Anita Bollmann-Giolai, Ilja Bezrukov, Detlef Weigel
Pubblicato in: PNAS, Numero Vol. 119, No. 52, December 27, 2022, 2022, ISSN 1091-6490
Editore: National Academy of Sciences of the United States of America (NAS)
DOI: 10.1073/pnas.2211881119

Other (1)

The relative effects of abiotic and biotic factors in explaining the structure of soil bacterial communities at diverse taxonomic levels

Autori: Baptiste Mayjonade, Rémy Zamar, Sébastien Carrere, Fabrice Roux
Pubblicato in: 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.10.29.620845