Understanding and predicting PATHOgen COMmunities

Información del proyecto

PATHOCOM

Identificador del acuerdo de subvención: 951444

DOI

10.3030/951444

Fecha de la firma de la CE 30 Junio 2021

Fecha de inicio 1 Julio 2021

Fecha de finalización 30 Junio 2028

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 9 945 744,00

Aportación de la UE

€ 9 945 744,00

Coordinado por

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

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Publicaciones

Peer reviewed articles (14)

The design of mapping populations: Impacts of geographic scale on genetic architecture and mapping efficacy for defense and immunity.

Autores: Andrew D. Gloss, Margaret C. Steiner, John Novembre, Joy Bergelson
Publicado en: Current Opinion in Plant Biology, Edición Volume 74, August 2023, 102399, 2023, ISSN 1369-5266
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2023.102399

The Genetic Architecture of <i>Arabidopsis thaliana</i> in Response to Native Non-Pathogenic Bacterial Species Revealed by Genome-Wide Association Mapping in Field Conditions

Autores: Daniela Ramírez-Sánchez, Rémi Duflos, Chrystel Gibelin-Viala, Rémy Zamar, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Publicado en: Phytobiomes Journal, Edición 8, 2024, Página(s) 556-567, ISSN 2471-2906
Editor: Scientific Societies
DOI: 10.1094/pbiomes-01-24-0010-r

Applying ecological principles to microbiome engineering

Autores: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Publicado en: Nature Microbiology, 2025, ISSN 2058-5276
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-025-02076-7

The plant immune receptor SNC1 monitors helper NLRs targeted by a bacterial effector

Autores: Ming-Yu Wang, Jun-Bin Chen, Rui Wu, Hai-Long Guo, Yan Chen, Zhen-Ju Li, Lu-Yang Wei, Chuang Liu, Sheng-Feng He, Mei-Da Du, Ya-long Guo, You-Liang Peng, Jonathan D.G. Jones, Detlef Weigel, Jian-Hua Huang, Wang-Sheng Zhu
Publicado en: Cell Host &amp; Microbe, Edición 31, 2024, Página(s) 1792-1803.e7, ISSN 1931-3128
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2023.10.006

The genetic and physiological basis of <i>Arabidopsis thaliana</i> tolerance to <i>Pseudomonas viridiflava</i>

Autores: Alejandra Duque‐Jaramillo, Nina Ulmer, Saleh Alseekh, Ilja Bezrukov, Alisdair R. Fernie, Aleksandra Skirycz, Talia L. Karasov, Detlef Weigel
Publicado en: New Phytologist, Edición 240, 2023, Página(s) 1961-1975, ISSN 0028-646X
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.19241

Toward Ecologically Relevant Genetics of Interactions Between Host Plants and Plant Growth‐Promoting Bacteria

Autores: Rémi Duflos, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Publicado en: Advanced Genetics, Edición 5, 2024, ISSN 2641-6573
Editor: Wiley
DOI: 10.1002/ggn2.202300210

Continental-scale associations of Arabidopsis thaliana phyllosphere members with host genotype and drought

Autores: Talia L. Karasov, Manuela Neumann, Laura Leventhal, Efthymia Symeonidi, Gautam Shirsekar, Aubrey Hawks, Grey Monroe, null null, A. Cristina Barragán, Ilja Bezrukov, Claudia Friedemann, Alba González Hernando, Anette Habring, Julia Hildebrandt, Sonja Kersten, Patricia Lang, Sergio M. Latorre, Miriam Lucke, Derek S. Lundberg, Ulrich Lutz, Fiona Paul, Fernando A. Rabanal, Julian Regalado, Thanvi Sr
Publicado en: Nature Microbiology, Edición 9, 2024, Página(s) 2748-2758, ISSN 2058-5276
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-024-01773-z

Genetic architecture of the response of Arabidopsis thaliana to a native plant-growth-promoting bacterial strain

Autores: Daniela Ramírez-Sánchez, Chrystel Gibelin-Viala, Fabrice Roux, Fabienne Vailleau
Publicado en: Frontiers in Plant Science, Edición 14, 2023, ISSN 1664-462X
Editor: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2023.1266032

Evolutionary implications of host genetic control for engineering beneficial microbiomes

Autores: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Publicado en: Current Opinion in Systems Biology, Edición Volume 34, June 2023, 100455, 2023, ISSN 2452-3100
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.coisb.2023.100455

Building microbial synthetic communities: get inspired by the design of synthetic plant communities

Autores: Paloma Durán, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Publicado en: New Phytologist, Edición 246, 2025, Página(s) 402-405, ISSN 0028-646X
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.70011

Spatial metatranscriptomics resolves host–bacteria–fungi interactomes

Autores: Sami Saarenpää, Or Shalev, Haim Ashkenazy, Vanessa Carlos, Derek Severi Lundberg, Detlef Weigel, Stefania Giacomello
Publicado en: Nature Biotechnology, Edición 42, 2024, Página(s) 1384-1393, ISSN 1087-0156
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01979-2

Genome-wide association studies in plant pathosystems: success or failure?

Autores: Choghag Demirjian, Fabienne Vailleau, Richard Berthomé, Fabrice Roux
Publicado en: Trends in Plant science, Edición Volume 28, Edición 4, April 2023, 2023, Página(s) 471-485, ISSN 1360-1385
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tplants.2022.11.006

The Genetic Architecture of Adaptation to Leaf and Root Bacterial Microbiota in Arabidopsis thaliana

Autores: Fabrice Roux, Léa Frachon, Claudia Bartoli
Publicado en: Molecular Biology and Evolution, Edición Volume 40, Edición 5, May 2023, msad093, 2023, ISSN 0737-4038
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msad093

Contrasting patterns of microbial dominance in the Arabidopsis thaliana phyllosphere

Autores: Derek S. Lundberg, Roger de Pedro Jové, Pratchaya Pramoj Na Ayutthaya, Talia L. Karasov, Or Shalev, Karin Poersch, Wei Ding, Anita Bollmann-Giolai, Ilja Bezrukov, Detlef Weigel
Publicado en: PNAS, Edición Vol. 119, No. 52, December 27, 2022, 2022, ISSN 1091-6490
Editor: National Academy of Sciences of the United States of America (NAS)
DOI: 10.1073/pnas.2211881119

Other (1)

The relative effects of abiotic and biotic factors in explaining the structure of soil bacterial communities at diverse taxonomic levels

Autores: Baptiste Mayjonade, Rémy Zamar, Sébastien Carrere, Fabrice Roux
Publicado en: 2024
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.10.29.620845