Understanding and predicting PATHOgen COMmunities

Projektinformationen

PATHOCOM

ID Finanzhilfevereinbarung: 951444

DOI

10.3030/951444

EK-Unterschriftsdatum 30 Juni 2021

Startdatum 1 Juli 2021

Enddatum 30 Juni 2028

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 9 945 744,00

EU-Beitrag

€ 9 945 744,00

Koordiniert durch

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (14)

The design of mapping populations: Impacts of geographic scale on genetic architecture and mapping efficacy for defense and immunity.

Autoren: Andrew D. Gloss, Margaret C. Steiner, John Novembre, Joy Bergelson
Veröffentlicht in: Current Opinion in Plant Biology, Ausgabe Volume 74, August 2023, 102399, 2023, ISSN 1369-5266
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2023.102399

The Genetic Architecture of <i>Arabidopsis thaliana</i> in Response to Native Non-Pathogenic Bacterial Species Revealed by Genome-Wide Association Mapping in Field Conditions

Autoren: Daniela Ramírez-Sánchez, Rémi Duflos, Chrystel Gibelin-Viala, Rémy Zamar, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Veröffentlicht in: Phytobiomes Journal, Ausgabe 8, 2024, Seite(n) 556-567, ISSN 2471-2906
Herausgeber: Scientific Societies
DOI: 10.1094/pbiomes-01-24-0010-r

Applying ecological principles to microbiome engineering

Autoren: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, 2025, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-025-02076-7

The plant immune receptor SNC1 monitors helper NLRs targeted by a bacterial effector

Autoren: Ming-Yu Wang, Jun-Bin Chen, Rui Wu, Hai-Long Guo, Yan Chen, Zhen-Ju Li, Lu-Yang Wei, Chuang Liu, Sheng-Feng He, Mei-Da Du, Ya-long Guo, You-Liang Peng, Jonathan D.G. Jones, Detlef Weigel, Jian-Hua Huang, Wang-Sheng Zhu
Veröffentlicht in: Cell Host &amp; Microbe, Ausgabe 31, 2024, Seite(n) 1792-1803.e7, ISSN 1931-3128
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2023.10.006

The genetic and physiological basis of <i>Arabidopsis thaliana</i> tolerance to <i>Pseudomonas viridiflava</i>

Autoren: Alejandra Duque‐Jaramillo, Nina Ulmer, Saleh Alseekh, Ilja Bezrukov, Alisdair R. Fernie, Aleksandra Skirycz, Talia L. Karasov, Detlef Weigel
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 240, 2023, Seite(n) 1961-1975, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.19241

Toward Ecologically Relevant Genetics of Interactions Between Host Plants and Plant Growth‐Promoting Bacteria

Autoren: Rémi Duflos, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Veröffentlicht in: Advanced Genetics, Ausgabe 5, 2024, ISSN 2641-6573
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/ggn2.202300210

Continental-scale associations of Arabidopsis thaliana phyllosphere members with host genotype and drought

Autoren: Talia L. Karasov, Manuela Neumann, Laura Leventhal, Efthymia Symeonidi, Gautam Shirsekar, Aubrey Hawks, Grey Monroe, null null, A. Cristina Barragán, Ilja Bezrukov, Claudia Friedemann, Alba González Hernando, Anette Habring, Julia Hildebrandt, Sonja Kersten, Patricia Lang, Sergio M. Latorre, Miriam Lucke, Derek S. Lundberg, Ulrich Lutz, Fiona Paul, Fernando A. Rabanal, Julian Regalado, Thanvi Sr
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 9, 2024, Seite(n) 2748-2758, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-024-01773-z

Genetic architecture of the response of Arabidopsis thaliana to a native plant-growth-promoting bacterial strain

Autoren: Daniela Ramírez-Sánchez, Chrystel Gibelin-Viala, Fabrice Roux, Fabienne Vailleau
Veröffentlicht in: Frontiers in Plant Science, Ausgabe 14, 2023, ISSN 1664-462X
Herausgeber: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2023.1266032

Evolutionary implications of host genetic control for engineering beneficial microbiomes

Autoren: Lucas P. Henry, Joy Bergelson
Veröffentlicht in: Current Opinion in Systems Biology, Ausgabe Volume 34, June 2023, 100455, 2023, ISSN 2452-3100
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.coisb.2023.100455

Building microbial synthetic communities: get inspired by the design of synthetic plant communities

Autoren: Paloma Durán, Fabienne Vailleau, Fabrice Roux
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 246, 2025, Seite(n) 402-405, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.70011

Spatial metatranscriptomics resolves host–bacteria–fungi interactomes

Autoren: Sami Saarenpää, Or Shalev, Haim Ashkenazy, Vanessa Carlos, Derek Severi Lundberg, Detlef Weigel, Stefania Giacomello
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, Ausgabe 42, 2024, Seite(n) 1384-1393, ISSN 1087-0156
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01979-2

Genome-wide association studies in plant pathosystems: success or failure?

Autoren: Choghag Demirjian, Fabienne Vailleau, Richard Berthomé, Fabrice Roux
Veröffentlicht in: Trends in Plant science, Ausgabe Volume 28, Ausgabe 4, April 2023, 2023, Seite(n) 471-485, ISSN 1360-1385
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tplants.2022.11.006

The Genetic Architecture of Adaptation to Leaf and Root Bacterial Microbiota in Arabidopsis thaliana

Autoren: Fabrice Roux, Léa Frachon, Claudia Bartoli
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, Ausgabe Volume 40, Ausgabe 5, May 2023, msad093, 2023, ISSN 0737-4038
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msad093

Contrasting patterns of microbial dominance in the Arabidopsis thaliana phyllosphere

Autoren: Derek S. Lundberg, Roger de Pedro Jové, Pratchaya Pramoj Na Ayutthaya, Talia L. Karasov, Or Shalev, Karin Poersch, Wei Ding, Anita Bollmann-Giolai, Ilja Bezrukov, Detlef Weigel
Veröffentlicht in: PNAS, Ausgabe Vol. 119, No. 52, December 27, 2022, 2022, ISSN 1091-6490
Herausgeber: National Academy of Sciences of the United States of America (NAS)
DOI: 10.1073/pnas.2211881119

Other (1)

The relative effects of abiotic and biotic factors in explaining the structure of soil bacterial communities at diverse taxonomic levels

Autoren: Baptiste Mayjonade, Rémy Zamar, Sébastien Carrere, Fabrice Roux
Veröffentlicht in: 2024
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.10.29.620845