Skip to main content
Weiter zur Homepage der Europäischen Kommission (öffnet in neuem Fenster)
Deutsch Deutsch
CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
CORDIS

Computational Proteomics Training European Innovative Network

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Veröffentlichungen

Oktoberfest: Open‐source spectral library generation and rescoring pipeline based on Prosit (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Mario Picciani, Wassim Gabriel, Victor‐George Giurcoiu, Omar Shouman, Firas Hamood, Ludwig Lautenbacher, Cecilia Bang Jensen, Julian Müller, Mostafa Kalhor, Armin Soleymaniniya, Bernhard Kuster, Matthew The, Mathias Wilhelm
Veröffentlicht in: PROTEOMICS, Ausgabe 24, 2024, ISSN 1615-9853
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/pmic.202300112

Proteomic Profiling Towards a Better Understanding of Genetic Based Muscular Diseases: The Current Picture and a Look to the Future (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Marc Pauper, Andreas Hentschel, Malte Tiburcy, Sergi Beltran, Tobias Ruck, Ulrike Schara-Schmidt, Andreas Roos
Veröffentlicht in: Biomolecules, Ausgabe 15, 2025, Seite(n) 130, ISSN 2218-273X
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/biom15010130

Assessment and Prediction of Human Proteotypic Peptide Stability for Proteomics Quantification (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Cristina Chiva, Zahra Elhamraoui, Amanda Solé, Marc Serret, Mathias Wilhelm, Eduard Sabidó
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, Ausgabe 95, 2023, Seite(n) 13746-13749, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.3c02269

OpenMS WebApps: Building User-Friendly Solutions for MS Analysis (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Tom David Müller, Arslan Siraj, Axel Walter, Jihyung Kim, Samuel Wein, Johannes von Kleist, Ayesha Feroz, Matteo Pilz, Kyowon Jeong, Justin Cyril Sing, Joshua Charkow, Hannes Luc Röst, Timo Sachsenberg
Veröffentlicht in: Journal of Proteome Research, Ausgabe 24, 2025, Seite(n) 940-948, ISSN 1535-3893
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.4c00872

Intensity and retention time prediction improves the rescoring of protein‐nucleic acid cross‐links (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Arslan Siraj, Robbin Bouwmeester, Arthur Declercq, Luisa Welp, Aleksandar Chernev, Alexander Wulf, Henning Urlaub, Lennart Martens, Sven Degroeve, Oliver Kohlbacher, Timo Sachsenberg
Veröffentlicht in: PROTEOMICS, Ausgabe 24, 2024, ISSN 1615-9853
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/pmic.202300144

OpenMS 3 enables reproducible analysis of large-scale mass spectrometry data (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Julianus Pfeuffer, Chris Bielow, Samuel Wein, Kyowon Jeong, Eugen Netz, Axel Walter, Oliver Alka, Lars Nilse, Pasquale Domenico Colaianni, Douglas McCloskey, Jihyung Kim, George Rosenberger, Leon Bichmann, Mathias Walzer, Johannes Veit, Bertrand Boudaud, Matthias Bernt, Nikolaos Patikas, Matteo Pilz, Michał Piotr Startek, Svetlana Kutuzova, Lukas Heumos, Joshua Charkow, Justin Cyril Sing, Ayesha
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 21, 2024, Seite(n) 365-367, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02197-7

MS²Rescore 3.0 is a modular, flexible, and user-friendly platform to boost peptide identifications, as showcased with MS Amanda 3.0 (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Louise Marie Buur, Arthur Declercq, Marina Strobl, Robbin Bouwmeester, Sven Degroeve, Lennart Martens, Viktoria Dorfer, Ralf Gabriels
Veröffentlicht in: Journal of Proteome Research, 2024, ISSN 1535-3893
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-rvr9n

Rescoring Peptide Spectrum Matches: Boosting Proteomics Performance by Integrating Peptide Property Predictors Into Peptide Identification (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Mostafa Kalhor, Joel Lapin, Mario Picciani, Mathias Wilhelm
Veröffentlicht in: Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 23, 2024, Seite(n) 100798, ISSN 1535-9476
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.mcpro.2024.100798

Theoretical Assessment of Indistinguishable Peptides in Mass Spectrometry-Based Proteomics (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Zahra Elhamraoui, Eva Borràs, Mathias Wilhelm, Eduard Sabidó
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, Ausgabe 96, 2024, Seite(n) 15829-15833, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.4c02803

How to deal with internal fragment ions? (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Arthur Grimaud, Masa Babovic, Frederik Haugaard Holck, Ole N. Jensen, Veit Schwämmle
Veröffentlicht in: Molecular & Cellular Proteomics, 2025, Seite(n) 100896, ISSN 1535-9476
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.mcpro.2024.100896

WOMBAT-P: Benchmarking Label-Free Proteomics Data Analysis Workflows (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: David Bouyssié, Pınar Altıner, Salvador Capella-Gutierrez, José M. Fernández, Yanick Paco Hagemeijer, Peter Horvatovich, Martin Hubálek, Fredrik Levander, Pierluigi Mauri, Magnus Palmblad, Wolfgang Raffelsberger, Laura Rodríguez-Navas, Dario Di Silvestre, Balázs Tibor Kunkli, Julian Uszkoreit, Yves Vandenbrouck, Juan Antonio Vizcaíno, Dirk Winkelhardt, Veit Schwämmle
Veröffentlicht in: Journal of Proteome Research, Ausgabe 23, 2024, Seite(n) 418-429, ISSN 1535-3893
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.3c00636

Extended Reality for Public Understanding of Science: A Systematic Literature Review (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Prajwal DSouza, Nikoletta-Zampeta Legaki, Daniel Fernández Galeote, Juho Hamari
Veröffentlicht in: Proceedings of the 27th International Academic Mindtrek Conference, 2024, Seite(n) 168-175
Herausgeber: ACM
DOI: 10.1145/3681716.3681734

Suche nach OpenAIRE-Daten ...

Bei der Suche nach OpenAIRE-Daten ist ein Fehler aufgetreten

Es liegen keine Ergebnisse vor

Mein Booklet 0 0