Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Computational Proteomics Training European Innovative Network

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Publikacje

Oktoberfest: Open‐source spectral library generation and rescoring pipeline based on Prosit (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Mario Picciani, Wassim Gabriel, Victor‐George Giurcoiu, Omar Shouman, Firas Hamood, Ludwig Lautenbacher, Cecilia Bang Jensen, Julian Müller, Mostafa Kalhor, Armin Soleymaniniya, Bernhard Kuster, Matthew The, Mathias Wilhelm
Opublikowane w: PROTEOMICS, Numer 24, 2024, ISSN 1615-9853
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/pmic.202300112

Proteomic Profiling Towards a Better Understanding of Genetic Based Muscular Diseases: The Current Picture and a Look to the Future (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Marc Pauper, Andreas Hentschel, Malte Tiburcy, Sergi Beltran, Tobias Ruck, Ulrike Schara-Schmidt, Andreas Roos
Opublikowane w: Biomolecules, Numer 15, 2025, Strona(/y) 130, ISSN 2218-273X
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/biom15010130

Assessment and Prediction of Human Proteotypic Peptide Stability for Proteomics Quantification (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Cristina Chiva, Zahra Elhamraoui, Amanda Solé, Marc Serret, Mathias Wilhelm, Eduard Sabidó
Opublikowane w: Analytical Chemistry, Numer 95, 2023, Strona(/y) 13746-13749, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.3c02269

OpenMS WebApps: Building User-Friendly Solutions for MS Analysis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tom David Müller, Arslan Siraj, Axel Walter, Jihyung Kim, Samuel Wein, Johannes von Kleist, Ayesha Feroz, Matteo Pilz, Kyowon Jeong, Justin Cyril Sing, Joshua Charkow, Hannes Luc Röst, Timo Sachsenberg
Opublikowane w: Journal of Proteome Research, Numer 24, 2025, Strona(/y) 940-948, ISSN 1535-3893
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.4c00872

Intensity and retention time prediction improves the rescoring of protein‐nucleic acid cross‐links (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Arslan Siraj, Robbin Bouwmeester, Arthur Declercq, Luisa Welp, Aleksandar Chernev, Alexander Wulf, Henning Urlaub, Lennart Martens, Sven Degroeve, Oliver Kohlbacher, Timo Sachsenberg
Opublikowane w: PROTEOMICS, Numer 24, 2024, ISSN 1615-9853
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/pmic.202300144

OpenMS 3 enables reproducible analysis of large-scale mass spectrometry data (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Julianus Pfeuffer, Chris Bielow, Samuel Wein, Kyowon Jeong, Eugen Netz, Axel Walter, Oliver Alka, Lars Nilse, Pasquale Domenico Colaianni, Douglas McCloskey, Jihyung Kim, George Rosenberger, Leon Bichmann, Mathias Walzer, Johannes Veit, Bertrand Boudaud, Matthias Bernt, Nikolaos Patikas, Matteo Pilz, Michał Piotr Startek, Svetlana Kutuzova, Lukas Heumos, Joshua Charkow, Justin Cyril Sing, Ayesha
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 21, 2024, Strona(/y) 365-367, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02197-7

MS²Rescore 3.0 is a modular, flexible, and user-friendly platform to boost peptide identifications, as showcased with MS Amanda 3.0 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Louise Marie Buur, Arthur Declercq, Marina Strobl, Robbin Bouwmeester, Sven Degroeve, Lennart Martens, Viktoria Dorfer, Ralf Gabriels
Opublikowane w: Journal of Proteome Research, 2024, ISSN 1535-3893
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-rvr9n

Rescoring Peptide Spectrum Matches: Boosting Proteomics Performance by Integrating Peptide Property Predictors Into Peptide Identification (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Mostafa Kalhor, Joel Lapin, Mario Picciani, Mathias Wilhelm
Opublikowane w: Molecular & Cellular Proteomics, Numer 23, 2024, Strona(/y) 100798, ISSN 1535-9476
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.mcpro.2024.100798

Theoretical Assessment of Indistinguishable Peptides in Mass Spectrometry-Based Proteomics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Zahra Elhamraoui, Eva Borràs, Mathias Wilhelm, Eduard Sabidó
Opublikowane w: Analytical Chemistry, Numer 96, 2024, Strona(/y) 15829-15833, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.4c02803

How to deal with internal fragment ions? (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Arthur Grimaud, Masa Babovic, Frederik Haugaard Holck, Ole N. Jensen, Veit Schwämmle
Opublikowane w: Molecular & Cellular Proteomics, 2025, Strona(/y) 100896, ISSN 1535-9476
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.mcpro.2024.100896

WOMBAT-P: Benchmarking Label-Free Proteomics Data Analysis Workflows (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: David Bouyssié, Pınar Altıner, Salvador Capella-Gutierrez, José M. Fernández, Yanick Paco Hagemeijer, Peter Horvatovich, Martin Hubálek, Fredrik Levander, Pierluigi Mauri, Magnus Palmblad, Wolfgang Raffelsberger, Laura Rodríguez-Navas, Dario Di Silvestre, Balázs Tibor Kunkli, Julian Uszkoreit, Yves Vandenbrouck, Juan Antonio Vizcaíno, Dirk Winkelhardt, Veit Schwämmle
Opublikowane w: Journal of Proteome Research, Numer 23, 2024, Strona(/y) 418-429, ISSN 1535-3893
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.3c00636

Extended Reality for Public Understanding of Science: A Systematic Literature Review (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Prajwal DSouza, Nikoletta-Zampeta Legaki, Daniel Fernández Galeote, Juho Hamari
Opublikowane w: Proceedings of the 27th International Academic Mindtrek Conference, 2024, Strona(/y) 168-175
Wydawca: ACM
DOI: 10.1145/3681716.3681734

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Moja broszura 0 0