Ziel
Phospholipase A2 is a member of an important class of lipid degrading enzymes. To design relevant mutants of possible industrial significance and inhibitors of pharmaceutical use it is necessary to understand the molecular basis of the function of the enzyme. One interesting aspect of the activity of these enzymes is much higher activity for phospholipids in aggregates such as micelles and monolayers than for single phospholipid molecules in water.
The general objective of this project is to understand how phospholipase A2 binds aggregated phospholipids.
Simulation of phospholipid monolayers and phospholipase A2 on an aggregated substrate has been carried out. The monolayer appears to be highly disordered in contrast the Langmuir-Blodgett films studies in other simulations where the headgroups were confined to a planar surface. This indicates the importance of using explicitly defined solvent for the study of monolayers. The simulation of phospholipase A2 at a monolayer is in progress due to the complexity of the simulation and the inherently flexible nature of the monolayers. The enzyme was positioned with the interfacial recognition site towards the monolayer surface with the aim of studying the monolayer phospholipase interactions. A further aim is to study the movement of the substrate in and out of the active site of phospholipase A2.
A reasonable understanding of how phospholipase A2 binds monomeric substrates has been obtained. This understanding is being exploited in engineering phopholipases A2 with modified specificities. Simple electrostatic calculations have been fairly successful in predicting the change in stability of proteins due to charge engineering. Improved calculations indicate large compensating interaction energies for the mutant that did not behave as expected. The activity of a double mutant N89D/E92K is low and suggests that residue 92 is important in interacting with aggregated substrates either directly or possibly via calcium. An understanding of the dynamic behaviour of monolayers of phospholipids has also developed. The monolayers are intrinsically more flexible than bilayers. Explicit description of the water appears to be essential to describe the behaviour of amphiphile monolayers. Simulation of the monolayer-phospholipase complex is now in progress.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Chemiewissenschaften anorganische Chemie Erdalkalimetalle
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Lipide
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine Enzym
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Daten nicht verfügbar
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
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Koordinator
9712 CP GRONINGEN
Niederlande
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.