Skip to main content
Weiter zur Homepage der Europäischen Kommission (öffnet in neuem Fenster)
Deutsch de
CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
CORDIS
Inhalt archiviert am 2024-04-30

Protein design studies with two monomeric tim-barrel proteins: towards new active sites of chitinase and monomeric triosephosphate isomerase

Ziel



TIM-barrel proteins are known to perform many different enzymatic functions. The active sites of these proteins are always formed by the 8 loops following after the 8 ß-strands. In this project we wish to study the structural determinants of the enzymatic activity, substrate specificity and stability of monomeric TIM-barrel proteins, in particular of monoTIM and two related chitinases. It is the aim of the project to understand how the TIM-barrel basic structure is employed by nature for different enzymatic activities. This understanding should in the end permit the use of the TIM-barrel scaffold for the design and construction of enzymes with desired properties. Several crystal structures of both enzymes (with or without ligand bound in the active site) are available. The monoTIM studies will be aimed at changing the specificity. By changing the sequences of loop-6, loop-7 and loop-8 it will be attempted to make a sugar binding pocket (instead of a phosphate binding pocket) such that the specificity will be converted from a triosephosphate isomerase into a xylose isomerase, which is an important industrial enzyme in the food industry. The chitinase studies will be aimed at making a more simple, more active and more stable chitinase with a rationally designed substrate specificity. For the latter purpose comparative studies of the related chitinases will be conducted and site directed mutagenesis will be used to verify the role of their differences. Mutagenesis work on the chitinases will further concern for example replacing long protruding loops by short connections as well as making designed changes in active site loops. New chitinase variants will have important industrial applications in plant biotechnology. The expertise essential for these projects is abundantly available in this project, in particular protein crystallography, modelling, genetic engineering, biochemistry and enzymology, as well as expertise in organic chemistry and calorimetry which is essential for making special substrates and to study stability and binding constants, respectively. The major thrust of the project is to characterise chitinases and monoTIM further, as well as to rationally design new functional properties, in particular via changing the loops. It is anticipated that new rules will emerge from these studies that are of crucial importance for the redesign of protein function.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

Daten nicht verfügbar

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

CSC - Cost-sharing contracts

Koordinator

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
EU-Beitrag
Keine Daten
Adresse
1,Meyerhofstraße 1
69012 HEIDELBERG
Deutschland

Auf der Karte ansehen

Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (8)

Mein Booklet 0 0