Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-04-30

Protein design studies with two monomeric tim-barrel proteins: towards new active sites of chitinase and monomeric triosephosphate isomerase

Cel



TIM-barrel proteins are known to perform many different enzymatic functions. The active sites of these proteins are always formed by the 8 loops following after the 8 ß-strands. In this project we wish to study the structural determinants of the enzymatic activity, substrate specificity and stability of monomeric TIM-barrel proteins, in particular of monoTIM and two related chitinases. It is the aim of the project to understand how the TIM-barrel basic structure is employed by nature for different enzymatic activities. This understanding should in the end permit the use of the TIM-barrel scaffold for the design and construction of enzymes with desired properties. Several crystal structures of both enzymes (with or without ligand bound in the active site) are available. The monoTIM studies will be aimed at changing the specificity. By changing the sequences of loop-6, loop-7 and loop-8 it will be attempted to make a sugar binding pocket (instead of a phosphate binding pocket) such that the specificity will be converted from a triosephosphate isomerase into a xylose isomerase, which is an important industrial enzyme in the food industry. The chitinase studies will be aimed at making a more simple, more active and more stable chitinase with a rationally designed substrate specificity. For the latter purpose comparative studies of the related chitinases will be conducted and site directed mutagenesis will be used to verify the role of their differences. Mutagenesis work on the chitinases will further concern for example replacing long protruding loops by short connections as well as making designed changes in active site loops. New chitinase variants will have important industrial applications in plant biotechnology. The expertise essential for these projects is abundantly available in this project, in particular protein crystallography, modelling, genetic engineering, biochemistry and enzymology, as well as expertise in organic chemistry and calorimetry which is essential for making special substrates and to study stability and binding constants, respectively. The major thrust of the project is to characterise chitinases and monoTIM further, as well as to rationally design new functional properties, in particular via changing the loops. It is anticipated that new rules will emerge from these studies that are of crucial importance for the redesign of protein function.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

Brak dostępnych danych

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

CSC - Cost-sharing contracts

Koordynator

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Wkład UE
Brak danych
Adres
1,Meyerhofstraße 1
69012 HEIDELBERG
Niemcy

Zobacz na mapie

Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych

Uczestnicy (8)

Moja broszura 0 0