Obiettivo
TIM-barrel proteins are known to perform many different enzymatic functions. The active sites of these proteins are always formed by the 8 loops following after the 8 ß-strands. In this project we wish to study the structural determinants of the enzymatic activity, substrate specificity and stability of monomeric TIM-barrel proteins, in particular of monoTIM and two related chitinases. It is the aim of the project to understand how the TIM-barrel basic structure is employed by nature for different enzymatic activities. This understanding should in the end permit the use of the TIM-barrel scaffold for the design and construction of enzymes with desired properties. Several crystal structures of both enzymes (with or without ligand bound in the active site) are available. The monoTIM studies will be aimed at changing the specificity. By changing the sequences of loop-6, loop-7 and loop-8 it will be attempted to make a sugar binding pocket (instead of a phosphate binding pocket) such that the specificity will be converted from a triosephosphate isomerase into a xylose isomerase, which is an important industrial enzyme in the food industry. The chitinase studies will be aimed at making a more simple, more active and more stable chitinase with a rationally designed substrate specificity. For the latter purpose comparative studies of the related chitinases will be conducted and site directed mutagenesis will be used to verify the role of their differences. Mutagenesis work on the chitinases will further concern for example replacing long protruding loops by short connections as well as making designed changes in active site loops. New chitinase variants will have important industrial applications in plant biotechnology. The expertise essential for these projects is abundantly available in this project, in particular protein crystallography, modelling, genetic engineering, biochemistry and enzymology, as well as expertise in organic chemistry and calorimetry which is essential for making special substrates and to study stability and binding constants, respectively. The major thrust of the project is to characterise chitinases and monoTIM further, as well as to rationally design new functional properties, in particular via changing the loops. It is anticipated that new rules will emerge from these studies that are of crucial importance for the redesign of protein function.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze chimiche chimica organica
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
69012 HEIDELBERG
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.