Online-Portal für Protein-Engineering
Das Protein-Engineering hat in den letzten Jahren mit dem Aufkommen neuer Technologien, die Forscher bei der Konstruktion neuer Proteine unterstützen, eine Renaissance erfahren. Diese neuen Proteine verfügen über ein hohes Potential – nicht nur in der biologischen Forschung, sondern auch in einer Vielzahl anderer Bereiche von der Biomedizin bis hin zur Stromerzeugung. Das EU-finanzierte Projekt NEWPROT (An interactive protein engineering portal with validated software and database facilities) hat ein interaktives Portal für Protein-Engineering aufgebaut, das verschiedene Softwareprodukte beinhaltet, die Forschung und Entwicklung erleichtern. NEWPROT hat sowohl auf menschlicher als auch auf der Ebene der Software die Zusammenarbeit rationalisiert und Optimierungen am Self-Service-Portal (SSP) für Protein-Engineering vorgenommen. Prädiktive Technologien sind anhand von Mutations- und Designexperimenten experimentell validiert worden. Die Stärke des Portals liegt in der Entdeckung der Wirkung von Mutationen auf Proteinstabilität, -selektivität und -aktivität sowie auf der Herstellungsebene. Man gewährte den maßgeblichen Schlüsselfiguren wie beispielsweise Ingenieuren des Proteinsektors und weiteren interessierten Wissenschaftlern und Lehrkräften freien Zugang zu Software und Datenbanken. Das Portal stattet europäische Softwareunternehmen, die an diesem ambitionierten Projekt beteiligt sind, mit einer wichtigen Plattform aus, um ihre Fähigkeiten bei der Softwareentwicklung zu demonstrieren. Das Portal selbst wird für die tausenden Proteintechniker auf der ganzen Welt interessant sein, ob in der Industrie oder der akademischen Welt. Dies ermöglicht eine schnellere Medikamentenentwicklung, fördert die Produktion von Biokraftstoffen und unterstützt die Herstellung bestimmter Arten von Lebensmitteln. NEWPROT hat nun die Zusammenarbeit sowohl in der Human- als auch in der Softwareebene rationalisiert und das (SSP) für In-silico-Protein-Engineering optimiert. Zudem steht dieses interaktive SSP kostenlos zur Verfügung. Anweisungen in Bezug auf seine Verwendung und Funktionsfähigkeit stehen in mehreren YouTube-Videos auf dem Kanal NewProt tutorials zur Verfügung. Validierungsexperimente haben tatsächlich das Engineering synthetisch wertvoller Enzyme ermöglicht. Einige technisch entwickelte Biokatalysatoren wurden bereits von zwei kleinen und mittleren Unternehmen (KMU) vermarktet. NEWPROT hat daher diese beiden KMU mit hocheffizienten Instrumenten versorgt, um eine hervorragende und konkurrenzfähige Position in deren Geschäftsbereichen sicherzustellen. Die Forschungsresultate von NEWPROT haben eine Zusammenarbeit gefördert, die sich auf Therapien mit kleinen Molekülen konzentriert, die auf Autoimmunerkrankungen wie etwa rheumatoide Arthritis und chronisch-entzündliche Darmerkrankungen abzielt. Das Projekt hat eine überaus wichtige Rolle bei der Förderung der Nachhaltigkeit und der Verbesserung des globalen Lebensstandards gespielt und wird diese Aufgabe auch weiterhin übernehmen.
Schlüsselbegriffe
Protein-Engineering, in silico, NEWPROT, Selbstbedienungsportal, Self-Service-Portal, Mutationen
