Portale online per l’ingegneria delle proteine
Negli ultimi anni, si è assistito a una vera e propria rinascita dell’ingegneria delle proteine, favorita dallo sviluppo di nuove tecnologie che aiutano i ricercatori a creare nuovi esemplari. Questi ultimi possiedono un notevole potenziale non solo dal punto di vista della ricerca biologica, ma anche in un’ampia gamma di altri campi che vanno dalla biomedicina alla produzione di energia. Il progetto NEWPROT (An interactive protein engineering portal with validated software and database facilities), finanziato dall’UE, ha dato vita a un portale interattivo per l’ingegneria delle proteine il quale integra diversi prodotti software al fine di facilitare la ricerca e lo sviluppo. L’iniziativa NEWPROT ha promosso la collaborazione sia a livello umano sia a livello software ottimizzando il portale self-service (SSP) dedicato all’ingegneria delle proteine. Le tecnologie predittive sono state validate a livello sperimentale con esperimenti di mutazione e design. Il punto di forza di questo strumento consiste nella sua capacità di studiare l’effetto delle mutazioni sulla stabilità, la selettività e l’attività delle proteine, nonché sul livello di produzione. È stato fornito libero accesso a software e banche dati per gli studiosi chiave, come per esempio gli ingegneri delle proteine, altri scienziati interessati e docenti. Questo strumento offre alle aziende di software europee coinvolte in questa ambiziosa iniziativa un’importante vetrina per le loro capacità. Il portale stesso sarà in grado di attirare migliaia di ingegneri delle proteine sparsi in tutto il mondo, sia in campo industriale sia in campo accademico. Tale scenario garantirà una più rapida progettazione di nuovi farmaci, faciliterà la produzione di biocarburanti e sosterrà la produzione di specifiche tipologie di alimenti. Il progetto NEWPROT ha semplificato la collaborazione sia a livello umano che software e ottimizzato il relativo SSP per l’ingegneria proteica insilico. È importante sottolineare che tale (SSP) interattivo è liberamente disponibile, e le istruzioni per l’utilizzo e le funzionalità sono disponibili tramite diversi video YouTube nel canale NewProt tutorials. Gli esperimenti di validazione hanno effettivamente permesso la progettazione di enzimi sinteticamente utili, e alcuni biocatalizzatori ingegnerizzati sono già stati commercializzati da parte di due piccole e medie imprese (PMI). NEWPROT ha quindi fornito a queste piccole e medie imprese gli strumenti più efficaci per garantire eccellenza e competitività nei rispettivi settori. I risultati della ricerca NEWPROT hanno favorito una collaborazione che si sta concentrando su terapie con piccole molecole che hanno come target malattie autoimmuni come per esempio l’artrite reumatoide e le malattie infiammatorie croniche intestinali. Il progetto ha svolto e continuerà a svolgere un ruolo importante nel promuovere la sostenibilità e il miglioramento del tenore di vita a livello globale.
Parole chiave
Ingegneria proteica, in silico NEWPROT, portale self-service, mutazioni
