Un portal virtual sobre ingeniería de proteínas
La ingeniería de proteínas se ha visto renovada en los últimos años debido a la aparición de nuevas tecnologías que auxilian a los investigadores a la hora de desarrollar proteínas nuevas. Estas nuevas proteínas ofrecen un potencial significativo no sólo en la investigación de la biología, sino también en una variedad de otros campos que van desde la biomedicina a la producción de energía. El proyecto NEWPROT (An interactive protein engineering portal with validated software and database facilities), financiado con fondos europeos, ha creado un portal virtual de ingeniería de proteínas que incorpora distintos productos de software para facilitar las tareas de investigación y desarrollo. NEWPROT ha racionalizado la colaboración, tanto a nivel humano como del software, y optimizado su portal de autoservicio (SSP) para la ingeniería de proteínas. Estas tecnologías predictivas se han validado mediante experimentos de mutación y diseño. El punto fuerte de ese portal radica en la capacidad para estudiar el efecto de las mutaciones en cuanto a estabilidad, selectividad y actividad de las proteínas y también al nivel de la producción. Tanto el software como las bases de datos son de acceso libre para los colectivos pertinentes, como especialistas en ingeniería de proteínas, científicos y docentes. El portal SSP ofrece a las empresas de desarrollo de software europeas involucradas en esta ambiciosa iniciativa una gran oportunidad para hacer gala de la capacidad de sus programas. La plataforma en sí misma resultará atractiva para los miles de ingenieros de proteínas que se encuentran repartidos por el mundo, pertenezcan al ámbito industrial o al académico. Esto permite un diseño más rápido de nuevos medicamentos, facilita la producción de biocombustibles y apoya la producción de ciertos tipos de alimentos. NEWPROT ha racionalizado la colaboración a nivel humano y del software y ha optimizado su (SSP) para ingeniería de proteínas in silico. Cabe destacar que este SSP interactivo es de acceso gratuito. Se pueden consultar instrucciones sobre su uso y funciones en varios vídeos de YouTube, a través del canal NewProt tutorials. Los experimentos de validación han hecho posible la ingeniería de enzimas que poseen utilidad sintética. Dos pymes ya han comercializado unos biocatalizadores artificiales. Así, NEWPROT ha brindado a esas dos pymes herramientas muy eficaces para lograr un rendimiento excelente y competitivo en sus áreas de actividad. Los resultados de la investigación de NEWPROT han impulsado una colaboración en torno a terapias con moléculas pequeñas enfocadas hacia enfermedades autoinmunes como la artritis reumatoide y la enfermedad inflamatoria intestinal. El proyecto ha cumplido y seguirá cumpliendo un papel importante en cuanto a impulsar la sostenibilidad y mejorar el nivel de vida en todo el mundo.
Palabras clave
Ingeniería de proteínas, in silico, NEWPROT, portal de autoservicio, mutaciones
