La pathogenèse de la «superbactérie» de la pneumonie
Provoquée en premier lieu par Streptococcus pneumoniae, l'incidence des souches résistantes aux médicaments non-vaccins sont en hausse. Cela augmente le besoin de trouver des vaccins à vaste gamme efficaces afin de diminuer l'infection et d'améliorer la survie du patient, notamment dans le cas des nourrissons. Des scientifiques du projet TN-SEQ («Identification of genetic determinants involved in Streptococcus pneumoniae pathogenesis»), financé par l'UE, ont travaillé à l'identification des gènes associés à la croissance et à la pathogenèse de cette bactérie. À cette fin, ils ont utilisé une stratégie d'une désactivation d'insertion. Grâce à des micropuces et des méthodologies de séquençage de prochaine génération tels que le séquençage de transposon, les chercheurs ont mis le doigt sur les gènes cruciaux pour la survie de S. pneumoniae et de la pathogenèse. Les voies associées ont été identifiées à l'aide d'analyse statistique, d'analyse des voies, de reconstruction du réseau et de méthodes d'enrichissement de catégorie fonctionnelle. Par ailleurs, ils ont déterminé avec succès des facteurs affectant la persistance et la virulence de S. pneumoniae chez l'hôte. Cela a permis de sélectionner des médicaments et vaccins candidats prometteurs pour une recherche approfondie et la validation après la génération de gènes de désactivation. Les résultats du projet ont permis de déterminer les cibles de médicaments antibiotiques à travers des études de preuves de concept. Cela garantit une recherche approfondie et les résultats réussis des essais cliniques à venir diminueraient la gravité de ce pathogène menaçant la vie.
Mots‑clés
Pneumonie, infection, antibiotique, vaccin, résistant aux médicaments, pathogenèse, insertion knockout, séquençage de transposon
