Patogenesi del "superbacillo" della polmonite
Principalmente causata dallo Streptococcus pneumoniae, l'incidenza di ceppi farmacoresistenti non prevenibili tramite vaccino è in crescita. Ciò aumenta la necessità di trovare vaccini efficaci ad ampio spettro per ridurre l'infezione e migliorare la sopravvivenza dei pazienti, in particolare nel caso dei neonati. Gli scienziati del progetto TN-SEQ ("Identification of genetic determinants involved in Streptococcus pneumoniae pathogenesis"), finanziato dall'UE, hanno lavorato per identificare i geni associati alla crescita e alla patogenesi di questo batterio. A tal fine hanno utilizzato una strategia di insertion knockout. Grazie a microarray e metodologie di sequenziamento di prossima generazione come il sequenziamento dei trasposoni i ricercatori hanno isolato geni fondamentali per la sopravvivenza di S. pneumoniae e la sua patogenesi. Le vie di segnalazione associate sono state identificate utilizzando analisi statistiche, analisi dei pathway, ricostruzione dei network e metodi di arricchimento delle categorie funzionali. I ricercatori sono inoltre riusciti a determinare i fattori che influenzano la persistenza e virulenza nell'ospite di S. pneumoniae. Ciò ha contribuito a selezionare candidati promettenti per farmaci e vaccini, per ulteriori studio e convalida dopo la creazione dei knock-out. Gli esiti del progetto hanno aiutato a determinare promettenti bersagli per i farmaci antibiotici tramite studi proof-of-concept. Questi garantiscono ulteriore approfondimento, e gli esiti positivi nelle sperimentazioni cliniche future mitigherebbero la gravità di questo patogeno potenzialmente letale.
