À la recherche de cibles antibiotiques
La résistance aux antibiotiques est devenue une question de santé publique importante car les traitements conventionnels se sont révélés incapables de résoudre le problème. La synthèse d'une troisième génération de molécules antibiotiques n'a pour l'instant pas réussi à résoudre le problème des espèces bactériennes résistantes aux antibiotiques, un échec qui souligne combien de nouvelles approches sont maintenant nécessaires. Dans ce contexte, les chercheurs du projet BONAFIDE («Banking on new antimicrobials: translational fidelity impairment»), financé par l'UE, ont proposé une stratégie permettant d'identifier des cibles nouvelles contre lesquelles nous pourrions développer de nouveaux antibiotiques. Ces cibles thérapeutiques devant être essentielles pour la propagation et la pathogénèse des bactéries, le consortium du projet a décidé d'évaluer le potentiel d'enzymes capables de modifier les ARN de transfert ou tRME (tRME, pour tRNA-modifying enzymes). Les tRME participent à la synthèse des protéines dans tous les compartiments du monde vivant, que ce soit les bactéries ou l'homme. Même si la perturbation de la machinerie de production protéique est une voie de stratégie antimicrobienne déjà explorée, les partenaires du projet BONAFIDE ont cette fois tenté d'impacter spécifiquement la fidélité et l'efficacité de cette synthèse. Dans ce cadre, les chercheurs ont développé un outil susceptible de suivre les erreurs produites lors de la synthèse protéique en se basant sur une méthode de fluorescence. Ils ont ainsi pu identifier six tRME essentiels à la pathogénicité des salmonelles. En altérant la séquence de ces tRME, les chercheurs ont montré sur une souris modèle que les salmonelles modifiées devenaient incapables de provoquer une fièvre typhoïde. Malgré la nouveauté de cette approche, il est indispensable de noter le risque potentiel associé à la conservation évolutive des tRME dans le règne vivant. Afin d'éviter l'homologie des tRME bactériennes et humaines et donc la toxicité de leurs inhibiteurs potentiels, les scientifiques recherchent des molécules spécifiques aux tRME bactériennes. L'étude BONAFIDE nous apporte non seulement des informations mécanistiques sur le rôle des tRME dans la virulence bactérienne mais démontre également qu'il est possible d'en altérer la virulence en ciblant la précision et l'exactitude de sa synthèse protéique. Cette approche nous ouvre ainsi de nouvelles opportunités pour la synthèse de molécules antibiotiques capables de répondre au problème majeur de la résistance bactérienne.
