Badanie drzewa genealogicznego lwa
W celu zapewnienia skuteczniejszej ochrony naturalnej różnorodności gatunku konieczne jest dokładniejsze poznanie ewolucji lwa oraz zależności między populacjami. W tym kontekście w ramach inicjatywy SIMBA (Search for innate markers of Barbary affinity) stworzono biblioteki genomowe na podstawie dawnego DNA oraz DNA pochodzącego z wymarłych i zagrożonych populacji lwów. Partnerzy projektu przebadali ponad 100 pochodzących ze zbiorów muzealnych i ogrodów zoologicznych próbek rzadkich oraz wymarłych populacji, a także współcześnie żyjących lwów (Panthera leo). Po wstępnych testach 75 z nich uznano za wystarczająco dobrze zachowane, by można było stworzyć wysokiej jakości biblioteki genomowe. Biblioteki te poddano następnie amplifikacji, indeksacji i sekwencjonowaniu, aby uzyskać sekwencje mitochondrialnego DNA (mitogenomu). Wstępne dane wykorzystano do zbudowania kompletnych mitogenomów dla szeregu próbek pochodzących od populacji lwów północnoafrykańskich, przylądkowych, gabońskich, irańskich, senegalskich i sudańskich. Uczeni użyli najlepszych bibliotek do uzyskania jądrowego DNA z najważniejszych obszarów naturalnego występowania P. leo. Chodzi tu między innymi o wymarłe populacje północnoafrykańskie, irańskie i przylądkowe oraz plejstoceńskiego lwa jaskiniowego. Do wyników należy kompletny mitogenom plejstoceńskiego lwa jaskiniowego (Panthera spelaea) oraz badania filogenetyczne nad rodzajem Panthera. Filogenetyka wykorzystywana jest do badania zależności ewolucyjnych między gatunkami i populacjami. Ewolucyjny rozwój gatunków lwa badano także w oparciu o mitogenomy. Między innymi zidentyfikowano przydane warianty sekwencji DNA nazywane polimorfizmami pojedynczego nukleotydu, aby wydzielić regionalne populacje lwa, na przykład lwa berberyjskiego. Wyniki badań prowadzonych w projekcie SIMBA są gorąco dyskutowane przez specjalistów ochrony gatunków. Nawiązano współpracę z organizacją African Lion Working Group w celu złożenia petycji w Międzynarodowej Unii Ochrony Przyrody (IUCN) dotyczącej objęcia specjalną ochroną określonych regionalnych populacji lwów.
Słowa kluczowe
Wyginięcie, podgatunek, lwy, berberyjskie, mitogenom
