Se pencher sur le repliement des protéines
Les protéines sont des acteurs importants dans la composition et le fonctionnement cellulaire et leur rôle est gouverné par leur conformation tridimensionnelle. Pour assurer un repliement correct, les cellules utilisent des chaperons moléculaires spécifiques. L'incapacité à se replier entraîne l'inactivité des protéines qui seront ultérieurement détruites. Parfois, les protéines mal repliées se forment et cela peut entraîner des maladies comme la maladie d'Alzheimer. L'initiative MANIFOLD (Manipulating folding, assembly and disassembly of protein complexes - from molecule to disease), financée par l'UE, est organisée par les chercheurs et les enseignants de la Bijvoet Graduate School for Biomolecular Sciences aux Pays-Bas. L'objectif est de recruter des chercheurs en début de carrière pour étudier différents aspects des évènements de repliement de protéines. Les activités proposées se concentrent sur le repliement des protéines récemment synthétisées, les changements conformationnels des protéines une fois activées ou désactivées ainsi que les effets allostériques. MANIFOLD étudiera également le phénomène du mauvais repliement de protéines et comment il entraîne la formation des structures amyloïdes. Pendant la première partie du projet, les chercheurs ont utilisé diverses méthodes biophysiques pour étudier les interactions de la protéine de formation d'amyloïde IAPP avec les membranes. Ils ont identifié des inhibiteurs prometteurs qui peuvent interagir avec ce processus et pourraient servir de médicaments thérapeutiques pour les conditions neurodégénératives. De plus, ils ont utilisé la protéine du choc thermique 90 (Hsp90) comme modèle pour analyser l'interaction de chaperon avec leurs substrats et comment cela entraîne la dégradation des protéines. Afin d'étudier l'assemblage de plusieurs protéines, le consortium a produit des histones et a observé leur repliement autour de l'ADN pour générer des nucléosomes. Les chercheurs se sont penchés sur l'interaction avec la molécule d'histone chaperon APLF et son rôle dans la formation du nucléosome. Dans l'ensemble, les activités du projet MANIFOLD fourniront des renseignements mécaniques importants dans le processus fondamental du repliement des protéines. Considérant l'implication des perturbations de repliement de protéines dans les cas de maladie, les informations générées ont également des conséquences thérapeutiques.
