Trabajo conjunto en genómica entre Oriente y Occidente
Como su propio nombre indica, los retrogenes son genes inversos. Cuando los genes se transcriben a ARN, el siguiente paso en condiciones normales es su traducción a proteínas. No obstante, en ocasiones, por alteraciones bioquímicas, el ARN se transcribe de forma inversa y se convierte nuevamente en ADN en una posición diferente con un nuevo código promotor para iniciar la producción de proteína. Esto puede suponer un nuevo gen con una función completamente nueva y un posible avance evolutivo. El objetivo del proyecto financiado por la Unión Europea EVOLGEN (Genome sciences - Evolutionary and functional perspective) es estudiar los retrogenes. El proyecto también estudia los intrones, que son porciones de un gen que no se transcriben pero que participan en procesos de regulación complejos como la producción de muchas proteínas a partir de un solo gen. El proyecto ha sido pionero en la creación de la base de datos RetrogeneDB, que incluye información de más de seiscientos mil retrogenes en sesenta y dos genomas animales. Para los evolucionistas es una prioridad estudiar el cambio de organismos unicelulares a multicelulares, y en la investigación de EVOLGEN se analizan dos genomas de algas en busca de retrogenes para intentar explicar cómo ocurrió este fenómeno. Los científicos de EVOLGEN también descubrieron un gran número de intrones anidados (es decir, intrones dentro de intrones) que hasta el momento eran desconocidos en los intrones de tipo U12. Se ha realizado un análisis comparativo de los transcriptomas de amebas unicelulares muy diferentes, desde las parásitas del encéfalo humano hasta las más comunes de agua dulce que se alimentan de otros organismos unicelulares. Entre las herramientas utilizadas está la más novedosa tecnología de secuenciación, la secuenciación de ADN de Oxford Nanopore, que sirve para obtener el genotipo de los parásitos de enfermedades tropicales. Muchas de estas enfermedades se presentan en Indonesia, por lo que los científicos diseñaron un método de análisis especial de fácil acceso con un navegador de Internet. La investigación colaborativa de EVOLGEN ha aparecido en once revistas con comité de lectura y también en varias ponencias leídas en congresos internacionales. Se espera que la investigación de EVOLGEN repercuta ampliamente en la bioquímica básica de muchas enfermedades así como en los microbios que pueden ser importantes para la producción biotecnológica. Esta colaboración entre laboratorios europeos y japoneses permitirá a muchos de los futuros científicos adquirir experiencia investigadora internacional.
Palabras clave
Genómica, colaboración, enfermedad, evolución, retrogenes, intrones
