Un travail d'équipe sur la génomique
Les rétrogènes sont, exactement comme le nom l'indique, des gènes inverses. Lorsque les gènes sont transcrits en ARN, l'étape suivante est la traduction en protéines. Néanmoins, quelques fois un mélange biochimique implique que l'ARN est transcrit à l'inverse et se réintègre à l'ADN, mais dans une position différente avec un nouveau code de promotion pour lancer la production de protéines, ce qui signifie un nouveau gène avec une nouvelle fonction, une étape possible dans l'évolution. Les rétrogènes sont les principaux sujets d'intérêt du projet EVOLGEN (Genome sciences - Evolutionary and functional perspective), financé par l'UE. Les autres sujets couverts incluent les introns, les morceaux d'un gène qui ne sont pas transcrits mais impliquent une régulation complexe comme la production de plusieurs protéines d'un seul gène. Le projet a déjà établi une une base de données RetrogeneDB avec des informations sur plus de 600 000 rétrogènes dans 62 génomes animaux. La transition d'une cellule unique à un complexe multicellulaire est un sujet très intéressant, et la recherche EVOLGEN a scanné deux génomes d'algues pour les rétrogènes pour découvrir comment cela fonctionne. Les chercheurs d'EVOLGEN ont aussi découvert un grand nombre de twintrons, des introns dans des introns, dans les introns de type U12. Une analyse comparative a été compilée sur les transcriptomes des micro-organismes unicellulaires très diversifiés (amibes), des parasites du cerveau humain, des organismes vivants et d'autres organismes unicellulaires. La boîte à outils de recherche comprenait la technologie de séquençage la plus récente, le séquençage d'ADN Oxford Nanopore, pour le génotypage des parasites de maladies tropicales. Compte tenu du nombre de maladies faisant leur apparition en Indonésie, les scientifiques ont développé une voie d'analyse spéciale facilement accessible à travers un navigateur web. La recherche collaborative EVOLGEN apparaît dans 11 revues à comité de lecture ainsi que dans de nombreuses présentations à des conférences internationales. L'impact de la recherche EVOLGEN promet d'affecter la biochimie fondamentale de nombreuses maladies ainsi que les microbes potentiellement importants dans la production biotechnologique. La collaboration entre les laboratoires japonais et européens signifie que les chercheurs de demain seront en possession d'une expérience de recherche mondiale.
Mots‑clés
Génomique, collaboration, maladie, évolution, rétrogènes, introns
