ARN long non codant - important dans le développement du système nerveux
Malgré de nombreuses preuves indiquant que le ncRNA est impliqué dans le développement du SNC, la recherche n'a pas enregistré d'analyse systématique du rôle qu'il joue. À l'aide de la drosophile, le projet LNCRNADROCNS a effectué une étude détaillée de l'expression longue du ncRNA (lncRNA) et de sa localisation au cours du développement du SNC de la drosophile. Les chercheurs ont utilisé le corps pédonculé (CP), une structure utilisée pour la formation de la mémoire, pour construire le système modèle. Les chercheurs ont mis au point un protocole pour purifier un type de neurone CP appelé cellules Kenyon (CK). À l'aide des CK de larves et de mouches adultes, l'équipe a soumis l'ARN poly-adénylé à un séquençage en profondeur en utilisant le reste des neurones dans le cerveau comme un contrôle. En collaboration avec un laboratoire de Harvard, les résultats ont été comparés aux données de séquençage d'une autre ligne de mouches, ainsi qu'à des neurones octopaminergiques. Les données ont été analysées par LNCRNADROCNS et des laboratoires d'Oxford et d’Edimbourg. Ensemble, ils ont développé un pipeline combinant des ensembles de novo et assistés par génome, suivi d'un filtrage approfondi. Les résultats des recherches montrent un chevauchement important entre les données du projet et les données de Harvard, ce qui en indique la fiabilité. En outre, pour confirmer cela, les données provenant des neurones octopaminergiques ne présentaient aucun chevauchement significatif avec les résultats du projet. Auprès d'un pool de 200 nouveaux lncRNA intergéniques et presque 1 000 identifiés précédemment, les chercheurs ont sélectionné 44 lncRNA sur la base de leur quantité dans les CP ou leurs niveaux élevés de transcription. Les résultats du projet suggèrent que les lncRNA ont un rôle spécialisé dans le développement du SNC, s'étendant éventuellement pour fonctionner. En raison de la complexité du tissu et des difficultés techniques, l'identification de la fonction exacte des transcriptions exige davantage de travail. Les recherches futures pour atteindre cet objectif doivent se concentrer sur la détection de petits nombres de molécules d'ARN dans le cerveau de la drosophile.
Mots‑clés
ARN long non codant, CNS, LNCRNADROCNS, corps pédonculé, cellule Kenyon
