W ramach unijnej inicjatywy związanej z sieciami gridowymi zidentyfikowano obiecujące składniki leków, które mogą zwalczać malarię
Uczestnicy inicjatywy finansowanej przez UE właśnie ukończyli serię wirtualnych badań przesiewowych mających na celu identyfikację składników leków zwalczających malarię. W okresie od 1 października 2006 r. do 31 stycznia 2007 r. w ramach projektu WISDOM (World-wide In Silico Docking On Malaria) analizowano średnio 80 000 składników na godzinę przy użyciu infrastruktury EGEE (udostępnienie gridów obliczeniowych nauce). Składniki były badane z zastosowaniem technik dokowania "in silico", dzięki którym naukowcy obliczali prawdopodobieństwo łączenia się potencjalnych leków z docelowym białkiem pasożyta malarii lub wejścia z nim interakcję. Ogółem przeanalizowano 140 mln wariantów połączeń składników leków z docelowym białkiem. Przez ponad 10 tygodni badań przesiewowych w projekcie wykorzystano moc obliczeniową odpowiadającą 420 latom pracy pojedynczego komputera. Jednocześnie pracowało około 5000 komputerów w 27 krajach, generując w sumie 2000 gigabajtów użytecznych danych. Dzięki wirtualnym badaniom przesiewowym naukowcy mogą wyeliminować zdecydowaną większość potencjalnych leków i skupić się w testach laboratoryjnych na najbardziej obiecujących składnikach. Przyspiesza to proces przesiewowy i zmniejsza koszt opracowania nowych leków przeciw takim chorobom, jak malaria. Według Domana Kima z Uniwersytetu Narodowego w Jeonnam w Korei, jednego z partnerów projektu, efekty projektu WISDOM wykraczają poza leczenie malarii. - Opracowaną metodę można rozszerzyć na wszystkie choroby, co otworzyłoby ekscytujące perspektywy przemysłowe. Do tej pory poszukiwania nowych leków w sektorze akademickim prowadzono na dość niewielką skalę, podczas gdy podejście WISDOM pozwala na systematyczną analizę wszystkich potencjalnie interesujących molekuł - powiedział. Nie po raz pierwszy w projekcie WISDOM prowadzono wirtualne szeroko zakrojone badania przesiewowe. W 2005 r. naukowcy połączyli z białkiem ponad 41 milionów składników i zidentyfikowali około 5000 interesujących związków. Wyodrębniono następnie trzy obiecujące rodziny molekuł, które mogą być skuteczne w walce z pasożytem malarii. Obecnie bardziej zaawansowane badania molekuł z wykorzystaniem dynamiki molekularnej prowadzą we Włoszech laboratoria na Uniwersytecie w Modenie i Instytut Technologii Biomedycznej, a we Francji - Krajowy Ośrodek Badań Naukowych (CNRS). Po zakończeniu tych badań laboratorium enzymologii na Uniwersytecie Narodowym w Jeonnam w Korei wykona testy in vitro.