Wyniki badań pokazują, że trzy białka E. coli decydują o przetrwaniu
Naukowcy z Kanady, USA i Wlk. Brytanii po raz pierwszy odkryli powiązanie między trzema białkami Escherichia coli (E. coli), które są niezbędne do przetrwania bakterii. Odkrycia te mają również duże znaczenie dla badań istotnych procesów dotyczących człowieka, gdyż jeden z genów występuje także w genomie człowieka. Wyniki badań opublikowano w czasopiśmie Journal of Bacteriology. "Mimo iż rodzaj i dokładna liczba istotnych genów przypuszczalnie zmieniają się w przypadku różnych gatunków bakterii, staje się jasne, że istnieje podstawowy zestaw genów niezbędnych do zapewnienia zdolności do życia prawdopodobnie większości bakterii" - czytamy w artykule. Naukowcy sprawdzili znaczenie trzech genów "zakonserwowanych" w genomie E. coli: yjeE, yeaZ oraz ygjD, które były obecne w bakterii w ciągu całego procesu jej ewolucji. Dzięki połączeniu podejścia genetycznego i biochemicznego do badania produktów białkowych tych genów (YjeE, YeaZ i YgjD) odkryto, że te trzy białka tworzą rzeczywiście "sieć interakcyjną" i biorą udział w tym samym, podstawowym procesie komórkowym. "Dokładne funkcje trzech, badanych przez nas, kluczowych białek komórkowych były jak dotąd owiane tajemnicą" - napisano w artykule. "Jednakże nie ma wątpliwości, że utrata któregokolwiek z tych trzech białek powoduje zdumiewające zmiany w morfologii E. coli." Co więcej, badania odkryły, że "główną, jeżeli nie jedyną, rolą YjeE oraz YeaZ jest regulacja aktywności YgjD". Obserwacje naukowców pokazały, że działanie YeaZ polega konkretnie na rozkładzie YgjD oraz wskazują, że "jedną z głównych funkcji YjeE jest kontrolowanie bądź regulowanie interakcji między YeaZ a YgjD". Gen ygjD zaobserwowano również w genomach innych form życia niż bakterie, w tym także u człowieka. Decydująca rola, jaką odgrywa ten gen w przetrwaniu E. coli skierowała uwagę na jego potencjalną rolę w rozwoju człowieka. "Odkrycie, że geny te mają zasadnicze znaczenie dla E. coli oraz, że występują w genomach innych gatunków, wskazuje na ich rzeczywiście ogromne znaczenie" - mówi Tracy Palmer z Uniwersytetu Dundee w Wlk. Brytanii. "Jeden z tych genów został również odkryty w genomie człowieka, co sprawia, że staje się on szczególnie interesujący. Niemniej tajemnicą pozostaje, co one dokładnie robią - ale cokolwiek to jest, musi być rzeczywiście ważne." Wyniki niektórych doświadczeń przeprowadzanych w ramach badań wskazują, że yjeE, yeaZ oraz ygjD wpływają na sposób reakcji komórek E. coli na różne komunikaty informujące je, kiedy mają się dzielić - powiedział profesor Palmer. "Jeżeli to samo robią w przypadku człowieka, wówczas problemy z tymi genami mogą z łatwością doprowadzić do zaburzeń rozwojowych czy raka" - wyjaśnia. Wyniki badań również pomagają w wyjaśnieniu, dlaczego te trzy białka są zakodowane w genomach niemal wszystkich bakterii oraz dlaczego mają decydujące znaczenie dla rozwoju, jako że wszystkie wchodzą w interakcje na tej samej ścieżce komórkowej. Autorzy mają nadzieję, że kolejne badania przyniosą dalsze informacje na temat konkretnych procesów komórkowych kontrolowanych przez te trzy białka. "Te badania są dobrym przykładem na to, że sekwencja genomu otwiera wiele możliwych dróg dociekań" - zauważa Douglas Kell z brytyjskiej Rady Badań Biologicznych i Biotechnologicznych, która sfinansowała projekt. "Nie pozostawiają również wątpliwości co do wartości zorganizowanego podejścia do poznawania i wykorzystania informacji o genomie. Badania skoncentrowane na optymalizacji wykorzystania sekwencji genomu z pewnością przyspieszą odkrycie informacji o znaczeniu gospodarczym i społecznym."
Kraje
Kanada, Zjednoczone Królestwo, Stany Zjednoczone