Caratterizzazione genetica della banca dei batteri marini
Il mare è un insieme di batteri. Questi batteri rivestono un ruolo fondamentale nel ciclo dell'azoto, del carbonio, del fosforo, dello zolfo e di altri elementi. Questo è pertinente per la capacità degli oceani di ospitare la vita, temperare il sistema climatico globale ed altri aspetti importanti. Tuttavia si sa poco di questi batteri marini, in quanto si sono rivelati molto difficili da coltivare in strutture di laboratorio. Per questa ragione il Nederlands Institute of Ecology (NIOO) si è unito al progetto di ricerca MIRACLE, che si proponeva di sviluppare nuovi metodi per identificare e differenziare i batteri microbici marini. Gli scienziati del NIOO hanno usato il sequenziamento per rilevare gli elementi esclusivi del codice genetico dei batteri. Sono stati raccolti campioni nel Mare del Nord, il Mar Baltico, e il Mar Ionio nel Mediterraneo. Il sequenziamento dell'acido ribonucleico ribosomiale 16S (16S rRNA) ha portato all'identificazione di oltre 200 sequenze esclusive. La ripartizione tra cianobatteri, batteri eterotrofici e plastidi eucariotici variava in modo significativo tra le regioni. Il NIOO inoltre ha isolato sequenze esclusive di operone ficoeritrina (cpeBA) in campioni di cianobatteri prelevati nel Mar Baltico. I risultati di questo lavoro saranno compilati in 14 librerie di cloni che saranno inviate alla GeneBank. MIRACLE segna un passo importante nella via che porta al miglioramento della nostra conoscenza della biodiversità microbica oceanica, e in futuro questo potrebbe aprire una porta per lo sfruttamento in applicazioni di medicina, biotecnologia, risanamento biologico ed altro ancora.
