Uno sguardo ad alta definizione nelle meccaniche della riparazione del DNA
Il progetto Dynasing (Dynamic single-molecule approach to DNA homologous recombination) ha studiato i meccanismi e le funzioni biologiche della ricombinazione omologa, un intricato scambio di sequenze tra molecole di DNA (acido desossiribonucleico) omologhe essenziale per la duplicazione genomica, la riparazione dei danni del DNA e la segregazione dei cromosomi. Gli obiettivi principali del progetto erano costituiti dall'analisi delle dinamiche da cui dipende lo scambio di filamenti di DNA e l'aggregazione e la scomposizione delle proteine, in modo da poter comprendere più approfonditamente il motivo per cui la ricombinazione omologa sotto forma di riparazione delle rotture del doppio filamento è limitata a determinate sedi. L'analisi di singole molecole può fornire informazioni sui meccanismi che si verificano a questo livello e sulle differenze nelle funzioni e nella struttura di queste molecole; l'obiettivo è molto importante per approfondire i meccanismi con cui le proteine partecipano a questo processo di ricombinazione e la formazione o la deformazione dei loro substrati di RNA. Con il progetto Dynasing è stata utilizzata una combinazione di metodi (scansione di forza, microscopia a fluorescenza e tecniche di imaging) per analizzare le proteine legate al DNA e le dinamiche molecolari a risoluzioni finora mai raggiunte. Questo approccio multiplo spianerà la via allo sviluppo di nuovi strumenti per analizzare sempre più a fondo la complessa aggregazione delle proteine. Sulla scia di questi progressi, i ricercatori sono riusciti a scoprire che il complesso proteico RMN (RAD50/MRE11/NBS1) ricopre un ruolo essenziale nella riparazione delle rotture del doppio filamento attraverso la ricombinazione omologa. Tra gli altri risultati positivi del progetto, è stato analizzato il movimento della proteina RAD54 umana con risoluzione nanometrica nell'ordine dei millisecondi.
