Caratterizzazione strutturale dinamica dell'azione dei farmaci
Nella ricerca di nuovi farmaci si utilizza una serie di metodi differenti in modo sinergico e sequenziale. Questi metodi includono sintesi e screening applicati ai grandi numeri, test biologici, biologia molecolare, modellizzazione computazionale, microscopia a elettroni, cristallografia a raggi X e spettroscopia RMN. Gli ultimi due metodi forniscono informazioni strutturali ad alta definizione sull'interazione tra farmaci e proteine, essenziali per comprendere il funzionamento preciso del farmaco. Malgrado l'uso consuetudinario della cristallografia a raggi X in quasi tutte le aziende farmaceutiche, essa affronta notevoli limitazioni. La spettroscopia RMN è una tecnica complementare e molto promettente che fornisce rapidamente informazioni strutturali e dinamiche sul complesso farmaco-proteine a risoluzione atomica. Fattore molto importante da considerare, la RMN supera molte delle limitazioni della cristallografia a raggi X, ampliando il numero di interazioni farmaco-proteine che possono essere chiarite. Il progetto NDDP ("NMR tools for drug design validated on phosphatases"), finanziato dall'UE, mirava a sviluppare approcci rapidi e integrati per la caratterizzazione strutturale delle interazioni farmaco-proteine utilizzando spettroscopia RMN all'avanguardia. I ricercatori di NDDP hanno sfruttato la forza complementare della cristallografia a raggi X e della RMN per l'esatta caratterizzazione strutturale e funzionale delle interazioni dinamiche tra recettore e farmaco a risoluzione atomica. Le informazioni ottenute forniscono un'eccellente contributo allo sviluppo e ottimizzazione di strategie di modellizzazione computazionale rapida per predire i farmaci con le migliori caratteristiche di interazione. Le fosfatasi costituiscono un'importante classe di bersagli farmacologici di ampio significato medico. I ricercatori NDPP hanno sviluppato una procedura che integra cristallografia a raggi X, screening RMN e modellizzazione computazionale per la progettazione efficace e rapida di farmaci che bersaglino le fosfatasi. Gli scienziati di NDDP si sono spinti oltre le attuali barriere delle tecnologie di progettazione dei farmaci mirati. Uno screening migliorato, rapido e di alta qualità dei farmaci e l'accurata determinazione interazionale e strutturale renderanno possibile far diventare consuetudinario l'utilizzo della RMN per un'efficace progettazione farmacologica.
